EEddNNBBIISSEE EEccoolleeddooccttoorraalleeNNoorrmmaannddee BBiioollooggiieeIInnttééggrraattiivvee,, SSaannttéé,, EEnnvviirroonnnneemmeenntt UNIVERSITÉ de CAEN/BASSE-NORMANDIE U.F.R : Institut de biologie fondamentale et appliquée École Doctorale Normande Biologie Intégrative, Santé et Environnement THÈSE Présentée par Mr Alexandre BERTHIER Et soutenue Le mardi 7 juin 2011 Transport du saccharose chez le ray-grass anglais (Lolium perenne L.) : réponse à la défoliation et à l’intensité lumineuse. En vue de l’obtention du DOCTORAT de l’UNIVERSITÉ de CAEN Spécialité : Biologie animale et végétale Arrêté du 07 août 2006 MEMBRES du JURY Mr R. LEMOINE, Directeur de Recherche, CNRS Poitiers (Rapporteur) Mr S. SAKR, Professeur, Université d’Angers, CNRS Angers (Rapporteur) Mr P. BARRE, Ingénieur de Recherche, INRA Lusignan (Examinateur) Mr A. VIAN, Professeur, Université d’Angers, INRA Angers (Examinateur) Mr F. MEURIOT, Maître de Conférences, Université de Caen (Co-Encadrant de Thèse) Mme N. NOIRAUD-ROMY, Maître de Conférences, Université de Caen (Co-Encadrante de Thèse) Mme M-P. PRUD’HOMME, Professeur, Université de Caen (Directrice de Thèse) REMERCIEMENTS C’est l’heure des remerciements. La thèse ne s’est pas accomplie toute seule. Elle a été en effet fédératrice et collaborative. C’est donc non sans une certaine appréhension et humilité que j’attaque cette phase de l’ascension rédactionnelle : les remerciements. J’y ai pensé de multiples fois, à chaque rencontre, à chaque étape clef, à chaque déception et à chaque réussite. Mes tous premiers remerciements s’adressent aux membres du jury qui ont accepté la lourde tâche d’évaluer ce manuscrit de thèse. Je suis très honoré que Mr. Rémi Lemoine et Mr. Soulaïman Sakr aient accepté d’être les rapporteurs de ma thèse et de juger ainsi mon travail. Je remercie également Mr. Alain Vian et Mr. Philippe Barre de l’intérêt qu’ils portent à ce manuscrit en acceptant d’en être les examinateurs. Je tiens à remercier chaleureusement le directeur du laboratoire, Frédéric Le Dily de m’avoir accueilli au sein de l’UMR INRA-UCBN 950 EVA nutritions NCS pour la réalisation de ma thèse. Je souhaite également remercier Mr Rémi Lemoine et toute son équipe pour m’avoir si bien accueilli au sein du laboratoire PHYMOTS de Poitiers et m’avoir permis de réaliser de si belles observations. Je voudrais remercier Philippe Barre (Lusignan INRA, URP3F) pour son aide sur la cartographie des gène LpSUT, pour avoir bien voulu répondre à mes nombreuses questions que cela soit par téléphone ou directement de visu, et aussi pour m’avoir aidé dans la recherche de nouvelles amorces de SUT. Je tiens à remercier très sincèrement mes trois encadrants, Marie, Nathalie et Fredo. Trio de choc que vous êtes, vous avez su me faire progresser, dépasser mes limites, m’encourager, et surtout prendre confiance en moi !! Pour toutes ces raisons, je vous suis éternellement reconnaissant. Je ne peux tout écrire ici mais je tiens à vous remercier spécialement chacun. Marie, un grand merci pour m’avoir fait confiance pour ce projet de thèse devenue réalité. Tu m’as permis de m’ouvrir aux autres, d’échanger scientifiquement avec le monde entier et de développer mon esprit d’ouverture envers les autres scientifiques. Tu es vraiment une personne extraordinaire je suis fier d’avoir travaillé à tes côtés. Je me souviendrai très longtemps des valeurs scientifiques que tu m’as inculquées. Au Panthéon des Femmes que j’ai rencontrées, tu tiens une place de choix. Nathalie, je t’adresse mes plus sincères remerciements pour avoir vu un potentiel bien caché durant mon M2R et m’avoir proposé la thèse. J’ai apprécié de travailler avec toi. Même si dès fois ça chauffe un peu, tu es franche et c’est tant mieux. Je voudrais te remercier tout particulièrement pour m’avoir soutenu et m’avoir permis d’obtenir un poster d’ATER et ainsi goûter aux joies de l’enseignement. J’en retire une expérience enrichissante. Enfin, j’espère qu’un jour nous repartirons en BM réaliser des manips de « ouf » comme nous les aimons. Fredo, je voudrais te remercier pour tout ce que tu m’as apporté durant cette thèse. J’espère avoir été à la hauteur d’un Maréchal d’Empire tel que le fut mon illustre ancêtre (si, si au 70 ème degré). Nous avons partagé tant de choses que j’ose utiliser une métaphore cinématographique que tu connais bien : Star Wars. Tu es mon maître Jedi de la science (Obiwan, sans la barbe. Quoique ça dépend des jours ;-)) et moi l’apprenti Padawan (Luke, sans les cheveux). Tes corrections sont aussi précises que le maniement du sabre laser par Yoda et la dextérité de tes envois de mails tard, très tard, ou même voire tôt le matin (plus rare ceux-là ;-)), n’avaient d’égale que la qualité de tes smileys d’encouragements. Tu as su me protéger du côté obscur. J’ai beaucoup appris à tes côtés mon Ami. Merci d’avoir partagé ton savoir. Ah oui ! J’oubliais moi aussi maintenant je vais pouvoir utiliser le cutter laser !  Je remercie l’ensemble des membres du labo passés et présents, pour m’avoir supporté malgré mes railleries, mes fous rires (voire mes rires fous), bref tout ce qui me caractérise. Je voudrais remercier Christine Gourbe, pour l’aide qu’elle a pu m’apporter dans les premières années que j’ai passé au labo. Merci Christine pour ta prévenance et ton aide. Je tiens à remercier la BM team (exclusivement féminine. Cela a du bon la BM : rien à voir avec les voitures allemandes !) Sandrine, Julie et Josiane. Je me souviendrai longtemps des matins avec le bonnet sur les oreilles pour ne pas attraper froid. Heureusement la chaleur de vos rires et la musique nous faisaient vite oublier la Sibérie. Votre aide quotidienne m’a permis de boucler l’ensemble des manips. Même quand il s’agit de faire plusieurs centaines de minipreps, de broyer des échantillons ou encore d’autoclaver à la chaîne, il y avait toujours l’une d’entre-vous. Je tiens à remercier l’équipe C-Défol (cela se prononce « c’est des folles !»). Eh oui les femmes ont une part importante dans la réussite de cette thèse. Dans cette équipe je me suis senti à l’aise dès le premier jour, cela doit sûrement venir de l’atmosphère dégagée par les fumées sortant du bureau d’une certaine personne. Merci à Annette pour son soutien, ses relectures et son éternel sourire. Merci à Marie-Laure, chef d’orchestre de l’HPLC sachant manier la seringue d’injection aussi bien que la baguette. Merci à toute l’équipe. Je voudrais remercier tous les participants aux récoltes qui ont épluché des centaines de grammes de BFC, des kilos de gaines et compté des milliers de talles. A vous tous merci ! Sans oublier l’enfer de la chambre froide (pour montrer aux petits nouveaux ce que c’est la science). Merci à vous tous. Je tiens à remercier Anne-Françoise et Raphaël pour leur excellent travail au sein de la serre, car avant d’avoir de beaux résultats, il faut de belles cultures de plantes. Comme dit toujours Fredo : de belles plantes, c’est déjà 50% de la manip réussie. Promis ! la prochaine fois que je cultive des Ray-grass, il n’y aura pas de pucerons. Merci à vous deux, notamment à toi Raph la gazelle, un jour je te doublerai dans une côte ! D’ailleurs pourquoi pas en Champagne ! J’aurai l’aide du terrain (ou pas...). Je remercie P. Laîné, pour avoir été le premier à m’accueillir en Normandie et également pour sa convivialité et son hospitalité. Je remercie toute l’équipe du laboratoire PHYMOTS Laurence, Fabienne, Florence, Magalie, Anne, Bruno, Mr Lemoine, mais également les thésards Audrey, Damien, Anna,.. Ainsi que cette ex Poitevine : je veux bien-sûr parler de toi Marjorie merci pour tous tes conseils pour l’immuno. Je voudrais remercier Céline et toute l’équipe de l’ESIX pour l’aide qu’ils m’ont apportée. Un petit clin d’œil à tous les étudiants de première année ESIX1. Durant cette thèse je n’ai pas seulement appris à réaliser une PCR en temps réel ou encore à réaliser une expression hétérologue, j’ai aussi appris à …. Tricoter merci donc au club des tricoteuses. Je suis en retard pour le dernier carré, mais il arrive. Je remercie également l’Association Française des Amateurs de Minitel et de Boulier (AFAMB). Merci Président Alain ! J’ai vraiment apprécié « bavarder » avec vous. Quel temps précieux de gagné pendant la thèse, grâce à ces fabuleuses machines. Je tiens à remercier Bénédicte pour avoir ouvert mon courrier afin de m’éviter une éventuelle contamination à l’Anthrax. Eh oui ! Nous sommes en plan vigipirate rouge. Je voudrais remercier toutes les personnes, de près ou de loin, qui ont trouvé le moyen de rendre compliquées les choses simples. Ils m’ont permis de me dépasser et d’acquérir d’autres compétences inattendues. Je tiens à remercier les plantes en particulier les Ray-grass, qui se sont fait disséquer, éplucher, broyer et lyophiliser sans jamais se plaindre. Qui a dit que la biologie était une science molle ? Maintenant que c’est à mon tour, j’ai une pensée pour les anciens doctorants en particulier Marie, Maha, Virginie et Fabrice. Merci pour votre soutien que ce soit par mail malgré les milliers de kilomètres, ou bien furtivement dans le couloir. J’en profite pour souhaiter bon courage aux prochains : Laetitia, Antonin, Marouf, Mustapha et Philippe. Le chemin est long mais le parcours est superbe, alors profitez du paysage ! Un grand remerciement à Romain. Romain, finalement, contrairement à Léonardo, tu as réussi à lire le petit papier et t’échapper du bloc C. Tu forces l’admiration ! J’espère sincèrement que notre amitié restera malgré des voies différentes et un certain éloignement. J’ai vraiment apprécié de te connaître et de partager ta passion pour la modélisation informatique. D’ailleurs, je te remercie pour tous les démontages/remontages de Mark I et reboutage d’Atari. J’ai apprécié tes qualités d’ingénieur informaticien et de modélisateur 3D hors du commun. Je tiens à remercier Antonin, compagnon d’arme, fou de plantes tout autant que moi. Je crois qu’on aurait pu nous attribuer au moins quatre fleurs pour le concours des bureaux fleuris. Pour toi, la fin (de la thèse !) approche également. Saches que tu peux compter sur moi pour les prochains mois ! De toute manière, on imposera la cadence en rotation par minute (RPM). Je te souhaite une réussite dans tes futurs choix, on va se revoir d’ailleurs à mon avis d’ici peu de temps. Une petite pensée pour ton Américaine. Annelise, tu vois finalement j’ai réussi à finir ! Je remercie les stagiaires que j’ai eu la chance d’encadrer : Pierre-Maxime et Dimitri. J’espère vous avoir transmis la passion de la science et le petit grain de folie qui permet de se lancer dans une thèse. Les gars, merci pour votre aide ! Un big up pour Anne G., José et Julien ancien M2R en train de devenir grand chercheur. Je tiens à remercier mes Kitzpotes (Vévé et Yoyo) « Das enfants terribles », pour leurs kitzcabrioles, la kitzaventure, leurs kitzshumours : La montagne, on la fracasse ! D’ailleurs, j’ai l’impression que grâce à vous j’ai souvent réussi à faire le vide dans le cerveau. (Eh oui ! Il n’est pas vide !) Je remercie tous mes potes les Nico and co. (Nico D. et Nico P.) et tous les autres. Je voudrais remercier Choco, compagnon de mes courtes nuits, toujours prêt à partager son bâton à la carotte avec moi pour éviter le coup de barre de la nuit. Dans la série animalière, je remercie les kangourous pour leur accueil. Promis ! Nous nous reverrons ! Je remercie également les bisounours…Ils auront eux aussi permis de forger mon caractère. Je voudrais remercier toute ma famille, et en particulier mes parents : mon Père pour ses fameux « ça va aller » qui remontent toujours le moral, et ma Mère pour le recul qu’elle m’a apporté face à cet exercice et pour m’avoir porté (et supporté) jusqu’à aujourd’hui. Merci à mon Frère et mes Grands-Parents d’avoir supporté l’éloignement. Cela n’a pas toujours été évident ! Je vous aime tous ! Enfin, je voudrais terminer ces remerciements en exprimant mes plus sincères remerciements à la logisticienne du moral, à celle qui m’a tenu et soutenu pendant ces 3 longues années, à celle qui a su me remettre sur le droit chemin, celle qui m’a gardé dans la réalité tout en me l’allègeant. Et en ces derniers instants, inlassable traqueuse de coquilles, relectrice au tempérament de feu, bibliographe à l’œil exercé, tu as été de tous les instants celle sur qui je pouvais compter. MERCI. Ces mots s’adressent à toi Charlotte, ma future épouse : Je t’aime. A tous merci car ce travail est le résultat d’un collectif.