CCCeeetttttteee aaaccctttiiiooonnn eeesssttt cccooofffiiinnnaaannncccéééeee pppaaarrr lll'''UUUnnniiiooonnn EEEuuurrrooopppéééeeennnnnneee... LLL'''EEEuuurrrooopppeee sss'''eeennngggaaagggeee dddaaannnsss llleee bbbaaassssssiiinnn dddeee lllaaa LLLoooiiirrreee aaavvveeeccc llleee FFFooonnnddd eeeuuurrrooopppéééeeennn dddeee dddééévvveeellloooppppppeeemmmeeennnttt rrrééégggiiiooonnnaaalll... Volet scientifique du programme d’action en faveur des poissons migrateurs : Rapport d'activité Du 01/01/13 au 31/12/13 Suivis biologiques des populations de poissons grands migrateurs du bassin de la Loire, année 2013 Jean Michel BACH, Timothé PAROUTY, Cédric LEON, Angéline SENECAL, Pierre PORTAFAIX, Quentin RIVARD, Adrien BARAULT & Aurore BAISEZ Et la participation de : Et la participation de : Adrien BONNIN, Quentin Rivard, Association LOGRAMI Loris BERNAGAUD, Lilian Pacaud, Coline BLANCHARD-MULLER Antenne Allier Audrey Cosyns, Mélanie HILAIRE, Amaury Regnault, Quentin MOREL, 8 rue de la ronde Amaury Favereau et Félix POINTEAU 03500 St Pourçain sur Sioule Adrien Barault [email protected] et [email protected] Association LOGRAMI Antenne Vienne 112 Faubourg de la Cueille Mirebalaise Remerciements pour leur contribution : 86000 POITIERS Marion Hoffmann-Legrand [email protected] Timothée Besse Mars 2014 Cette action est cofinancée par l'Union Européenne. L'Europe s'engage dans le bassin de la Loire avec le Fond européen de développement régional. BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 1 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. SOMMAIRE 1. Descriptif du programme d’actions 2013 ........................................................ 8 1.1. Contexte .................................................................................................... 8 1.2. Présentation générale des actions du programme ...........................................10 2. Les conditions environnementales en 2013 .................................................. 11 2.1. Les débits ..................................................................................................11 2.1.1. Le débit de la basse Loire ......................................................................12 2.1.2. Le débit de la Vienne ............................................................................12 2.1.3. Le débit de la Creuse ............................................................................13 2.1.4. Le débit de la moyenne Loire .................................................................14 2.1.5. Le débit de la Loire amont .....................................................................15 2.1.6. Le débit de l’Allier moyen ......................................................................15 2.1.7. Le débit de l’Allier amont .......................................................................16 2.2. Les températures de l’eau ............................................................................17 2.2.1. Les températures de l’eau sur le bassin de la Vienne .................................18 2.2.2. Les températures de l’eau sur le bassin de l’Allier .....................................18 2.2.3. Les températures de l’eau sur le bassin de la Loire amont .........................19 3. Action 1 : Réseau de stations de comptage................................................... 21 3.1. Généralités ................................................................................................21 3.2. Bilan du fonctionnement des passes à poissons en 2013 ..................................24 3.2.1. Fonctionnement des passes à poissons du bassin de la Vienne ...................24 3.2.2. Fonctionnement des passes à poissons du bassin de l’Allier ........................25 3.2.3. Fonctionnement des passes à poissons du bassin de la Loire amont ............27 3.3. Bilan du fonctionnement des stations de comptage en 2013 .............................28 3.3.1. Fonctionnement des stations de comptage du bassin de la Vienne ..............28 3.3.2. Fonctionnement des stations de comptage du bassin de l’Allier ...................30 3.3.3. Fonctionnement des stations de comptage du bassin de la Loire amont .......31 4. Les passages de Saumon atlantique (Salmo salar) ....................................... 33 4.1. Analyse des passages par bassin ..................................................................33 4.1.1. Analyse historique de répartition des effectifs aux différentes stations .........33 4.1.2. Répartition des effectifs en 2013 ............................................................33 4.2. Analyse des passages par stations ................................................................34 4.2.1. Sur la Creuse à Descartes ......................................................................34 4.2.2. Sur la Vienne à Châtellerault ..................................................................40 4.2.3. Sur la Gartempe à Châteauponsac ..........................................................42 4.2.4. Sur l’Allier à Vichy ................................................................................43 4.2.5. Sur l’Allier à Poutès ...............................................................................48 4.2.6. Sur la Loire à Decize .............................................................................53 4.2.7. Sur la Loire à Roanne ............................................................................55 4.2.8. Sur l’Arroux à Gueugnon .......................................................................55 4.3. Évaluation du programme de déversement des smolts ....................................56 4.3.1. Sur le bassin Creuse – Gartempe ............................................................56 4.3.2. Sur le bassin de l’Allier ..........................................................................58 4.3.3. Sur le bassin de la Loire amont ..............................................................61 5. Les passages de Truite de mer (Salmo trutta) .............................................. 63 6. Les passages d’aloses (Alosa) ...................................................................... 64 6.1. Analyse des passages par bassin ..................................................................64 6.1.1. Analyse historique de répartition des effectifs aux différentes stations .........64 6.1.2. Répartition des effectifs en 2013 ............................................................65 6.2. Analyse des passages par stations ................................................................66 6.2.1. Sur la Creuse à Descartes ......................................................................66 6.2.2. Sur la Vienne à Châtellerault ..................................................................68 6.2.3. Sur l’Allier à Vichy ................................................................................71 6.2.4. Sur la Loire à Decize .............................................................................73 6.2.5. Sur la Loire à Roanne ............................................................................77 6.2.6. Sur l’Arroux à Gueugnon .......................................................................77 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 2 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 7. Les passages de Lamproie marine (Petromyzon marinus) ............................ 78 7.1. Analyse des passages par bassin ..................................................................78 7.1.1. Analyse historique de répartition des effectifs aux différentes stations .........78 7.1.2. Répartition des effectifs en 2013 ............................................................78 7.2. Analyse des passages par stations ................................................................79 7.2.1. Sur la Creuse à Descartes ......................................................................79 7.2.2. Sur la Vienne à Châtellerault ..................................................................81 7.2.3. Sur l’Allier à Vichy ................................................................................84 7.2.4. Sur la Loire à Decize .............................................................................86 7.2.5. Sur la Loire à Roanne ............................................................................89 7.2.6. Sur l’Arroux à Gueugnon .......................................................................89 8. Les passages d’Anguille européenne (Anguilla anguilla) .............................. 91 8.1. Analyse des passages par stations ................................................................91 8.1.1. Sur la Creuse à Descartes ......................................................................91 8.1.2. Sur la Vienne à Châtellerault ..................................................................91 8.1.3. Sur l’Allier à Vichy ................................................................................94 8.1.4. Sur l’Allier à Poutès ...............................................................................95 8.1.5. Sur la Loire à Decize .............................................................................95 8.1.6. Sur la Loire à Roanne ............................................................................96 8.1.7. Sur l’Arroux à Gueugnon .......................................................................97 9. Les passages de Mulet porc (Liza ramada) ................................................... 98 9.1.1. Sur la Creuse à Descartes ......................................................................98 9.1.2. Sur la Vienne à Châtellerault ................................................................ 100 9.1.3. Sur la Loire à Decize ........................................................................... 102 10. Conclusion ................................................................................................ 103 11. Action 2 : Dénombrement et localisation des frayères de saumon atlantique sur l’Allier, la Gartempe et leurs affluents. ..................................................... 107 12. Méthode.................................................................................................... 107 12.1. Identification des frayères ........................................................................ 107 12.2. Méthodes de comptage ............................................................................ 108 12.3. Traitement des données .......................................................................... 109 13. Bassin de la Gartempe .............................................................................. 109 13.1. Efforts de prospection .............................................................................. 109 13.2. Résultats ............................................................................................... 110 13.2.1. Etude de faisabilité d’un survol en hélicoptère ...................................... 110 13.2.2. Frayères identifiées ........................................................................... 111 14. Bassin de l’Allier ....................................................................................... 112 14.1. Déroulement des opérations et effort de prospection ................................... 112 14.2. Frayères sur la rivière Alagnon ................................................................. 112 14.3. Frayères sur la rivière Sioule .................................................................... 113 14.3.1. Dénombrement et localisation 2013 .................................................... 113 14.3.2. Evolution interannuelle ...................................................................... 115 14.3.3. Discussions ...................................................................................... 115 14.4. Frayères sur la rivière Allier ...................................................................... 116 14.4.1. Dénombrement et localisation 2013 .................................................... 116 14.4.2. Evolution interannuelle ...................................................................... 118 14.4.3. Discussions ...................................................................................... 120 14.4.4. Retour sur les comptages 2012 .......................................................... 120 14.5. Conclusion ............................................................................................. 121 15. Action 3 : Suivi de la reproduction naturelle de la lamproie marine sur le Bassin Vienne ................................................................................................. 123 16. Méthodologie ............................................................................................ 124 16.1. Caractérisation des frayères de lamproies marines ...................................... 124 16.2. Zone d’étude .......................................................................................... 124 16.3. Principe et protocole de suivi .................................................................... 125 17. Résultats .................................................................................................. 125 17.1. Conditions de prospections ....................................................................... 125 17.2. Efforts de prospections ............................................................................ 126 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 3 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 17.3. Les Fronts de colonisation ........................................................................ 126 17.3.1. En 2013 ........................................................................................... 126 17.3.2. Comparaison et évolution interannuelle ............................................... 128 18. Conclusion ................................................................................................ 130 19. Action 4 : Reproduction naturelle de l’alose en aval des stations de comptage........................................................................................................ 131 20. Matériels et méthodes .............................................................................. 132 20.1. La frayère d’alose ................................................................................... 132 20.2. Secteurs d’études ................................................................................... 132 20.2.1. La Creuse en aval du barrage de Descartes .......................................... 133 20.2.2. La Loire en aval du barrage de Decize ................................................. 133 20.2.3. L’Allier en aval du barrage de Vichy ..................................................... 133 20.3. Dispositifs d’enregistrement ..................................................................... 133 20.4. L'analyse des enregistrements .................................................................. 134 20.5. Taux de restitution .................................................................................. 135 20.6. Calculs du nombre de bulls ...................................................................... 136 20.7. Estimation du nombre de géniteurs ........................................................... 136 20.8. Suivis complémentaires par prospections nocturnes .................................... 136 20.9. Mise en place du suivi .............................................................................. 136 21. Résultats .................................................................................................. 137 21.1. Détermination du nombre de bulls ............................................................ 137 21.1.1. Détermination du nombre de bulls sur la Creuse en aval du barrage de Descartes ................................................................................................... 137 21.1.2. Détermination du nombre de bulls sur la Loire en aval du barrage de Decize ................................................................................................................. 138 21.1.3. Détermination du nombre de bulls sur l’Allier en aval du barrage de Vichy ................................................................................................................. 141 21.2. Validation des nuits actives ...................................................................... 143 21.3. Estimation du nombre de géniteurs ........................................................... 143 21.4. Activité de reproduction et conditions environnementales ............................ 143 21.4.1. Sur la Creuse en aval du barrage de Descartes* ................................... 144 21.4.2. Sur la Loire en aval du barrage de Decize ............................................ 144 22. Discussion ................................................................................................ 145 23. Conclusion ................................................................................................ 147 24. Action 5 : Évaluation des potentialités de la Loire moyenne pour la reproduction des aloses et de la lamproie marine .......................................... 149 24.1. La zone d’étude ...................................................................................... 150 24.1.1. La Loire moyenne ............................................................................. 150 24.1.2. La continuité écologique sur le linéaire concerné ................................... 151 24.2. Les poissons migrateurs concernés par l’étude............................................ 152 24.2.1. Les aloses ........................................................................................ 152 24.2.2. La lamproie marine ........................................................................... 155 25. Matériel et méthodes ................................................................................ 158 25.1. Recueil des données disponibles ............................................................... 158 25.2. Repérage des frayères potentielles par photo-interprétation ......................... 159 25.3. Cartographie des frayères potentielles par prospection sur le terrain ............. 160 26. Résultats .................................................................................................. 161 26.1. Identification des frayères potentielles d’aloses et de lamproie marine sur la Loire moyenne ........................................................................................................ 161 26.1.1. Comparaison de la photo-interprétation et de la phase de terrain ........... 161 26.1.2. Cartographie des frayères potentielles en Loire moyenne ....................... 162 26.1.3. Caractérisation des frayères potentielles d’aloses et de lamproie marine sur la Loire moyenne : étude des surfaces ............................................................ 167 26.2. Répartition des frayères potentielles d’aloses et de lamproie marine sur le bassin versant de la Loire : étude comparative ............................................................. 170 27. Discussion ................................................................................................ 173 27.1. Discussion de la méthodologie et des résultats ........................................... 173 27.1.1. Conditions environnementales lors de la prospection sur le terrain .......... 173 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 4 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 27.1.2. La photo-interprétation ...................................................................... 173 27.1.3. Précision et pertinence des données récoltées sur le terrain ................... 174 27.2. La caractérisation des frayères potentielles ................................................ 174 27.2.1. Hypothèse sur les faibles effectifs d’aloses et de lamproie marine rencontrés sur la Loire .................................................................................................. 175 27.3. Perspectives d’amélioration des Connaissances ........................................... 175 27.3.1. Se focaliser sur le succès reproducteur ................................................ 175 27.3.2. Collecter les données manquantes ...................................................... 176 28. Conclusion ................................................................................................ 176 29. Action 6 : Suivi des migrations de la lamproie marine en aval des stations de comptages ...................................................................................................... 178 30. Matériel et méthodes ................................................................................ 178 30.1. Capture et marquage .............................................................................. 178 30.2. Système de détection des marques TIRIS .................................................. 179 31. Résultats .................................................................................................. 181 31.1. Effort d’échantillonnage ........................................................................... 181 31.2. Analyse biométrique de l’échantillon marqué .............................................. 182 31.2.1. Relation taille-poids .......................................................................... 182 31.2.2. Dimorphisme sexuel .......................................................................... 182 31.2.3. Dimorphisme lié à la période .............................................................. 183 31.3. Etat sanitaire de l’échantillon marqué ........................................................ 183 31.4. Détection des lamproies marquées ............................................................ 184 31.4.1. Caractéristiques des lamproies détectées ............................................. 184 31.4.2. Périodes et vitesses de migration ........................................................ 184 31.5. Estimation du nombre de migrants ............................................................ 186 31.6. Résultats complémentaires ...................................................................... 186 32. Discussions et conclusions ....................................................................... 187 32.1. Limite technique de la campagne de capture .............................................. 187 32.2. L’estimation du contingent en deçà des stations et les limites de la méthode .. 187 33. Action 7 : Cahier des charges du bon entretien des dispositifs de franchissement des ouvrages pour les poissons ............................................. 189 34. Situation sur le bassin Loire ..................................................................... 189 35. Efficacité d’un dispositif de franchissement .............................................. 192 35.1. Les principales causes de dysfonctionnement des dispositifs de franchissement ..................................................................................................................... 194 35.1.1. L’encombrement par des débris organiques et/ou corps dérivants ........... 194 35.1.2. L’engravement ................................................................................. 194 35.1.3. La dégradation physique du dispositif .................................................. 195 35.1.4. Une mauvaise gestion hydraulique ...................................................... 196 35.2. Préconisations générales à suivre pour la conception d’un dispositif de franchissement ............................................................................................... 196 36. Cahier des charges à l’usage des gestionnaires d’ouvrages ...................... 199 37. Guides et plaquettes à consulter .............................................................. 200 38. Action 8 : Etude de la survie des œufs de saumon atlantique sur les zones de reproduction du bassin de la sioule ................................................................ 202 39. Matériel et Méthode .................................................................................. 203 39.1. Localisation de l'étude ............................................................................. 203 39.1.1. Site d'étude ..................................................................................... 203 39.1.2. Localisation des frayères artificielles .................................................... 203 39.2. Réalisation des frayères artificielles ........................................................... 204 39.3. Caractéristiques physico-chimiques des frayères ......................................... 205 39.3.1. L'eau de surface ............................................................................... 205 39.3.2. L'eau interstitielle : Taux d'oxygénation du substrat .............................. 205 40. Résultats .................................................................................................. 206 40.1. Conditions générales d'incubation ............................................................. 206 40.2. Analyse des températures ........................................................................ 207 40.3. Analyse des débits .................................................................................. 209 40.4. La lecture des œufs ................................................................................. 211 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 5 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 40.5. La survie des œufs .................................................................................. 211 40.5.1. Comparaison entre les sites ............................................................... 211 40.5.2. Comparaison à l'intérieur des sites ...................................................... 213 40.6. Relation entre la survie des œufs et l'oxygène dissous dans l'eau .................. 213 40.7. Relation entre le taux de survie et le plus ou moins grand noircissement des bâtons hypoxie ............................................................................................... 215 41. Conclusion ................................................................................................ 217 42. Action 8 : Etude comparative de la survie des œufs de saumon atlantique sur les zones de reproduction du bassin de l’allier et de l’Alagnon ....................... 218 43. Matériel et méthode ................................................................................. 218 43.1. Localisation de l’étude ............................................................................. 218 43.1.1. Site d’étude ..................................................................................... 218 43.1.2. Localisation des frayères artificielles .................................................... 219 43.2. Réalisation des frayères artificielles ........................................................... 220 43.3. Caractéristiques physico-chimiques des frayères ......................................... 221 43.3.1. L’eau de surface ............................................................................... 221 43.3.2. L’eau interstitielle : Taux d’oxygénation du substrat .............................. 222 44. Rappel des résultats ................................................................................. 223 44.1. Etude Allier 2009-2010 ............................................................................ 223 44.2. Etude Alagnon 2010-2011 ........................................................................ 224 45. Avancée de l’étude 2013 ........................................................................... 224 46. Conclusion ................................................................................................ 226 47. Action 9 : Suivi de la production naturelle de juvéniles de saumon et de l’implantation des juvéniles déversés. ............................................................ 227 47.1. Contexte ................................................................................................ 227 47.2. Méthodologie .......................................................................................... 227 48. Bassin de la Gartempe .............................................................................. 229 48.1. Répartition et localisation des stations ....................................................... 229 48.2. Déversement des alevins ......................................................................... 232 48.3. Déroulement des pêches .......................................................................... 232 48.4. Résultats ............................................................................................... 232 48.4.1. Avertissement .................................................................................. 232 48.4.2. Résultats sur l’ensemble des stations .................................................. 233 48.4.3. Résultats sur les stations déversées .................................................... 234 48.5. Conclusion Gartempe .............................................................................. 242 49. Bassin de l’Allier ....................................................................................... 243 49.1. Préambule ............................................................................................. 243 49.2. Localisations des stations ......................................................................... 243 49.3. Caractérisation des stations ..................................................................... 245 49.4. Déroulement des pêches et conditions hydrologiques .................................. 247 49.5. Indices d’abondances .............................................................................. 247 49.5.1. A l’échelle du bassin de l’Allier ............................................................ 247 49.5.2. Alagnon ........................................................................................... 248 49.5.3. Allier ............................................................................................... 251 49.5.4. Chapeauroux .................................................................................... 258 49.5.5. Dore ............................................................................................... 259 49.5.6. Sioule .............................................................................................. 260 49.6. Dispersion des alevins natifs .................................................................... 263 49.7. Dispersion des alevins déversés ................................................................ 264 49.8. Caractéristiques morphologiques des tacons ............................................... 265 49.8.1. Tailles des tacons pêchés ................................................................... 265 49.8.2. Coefficient de condition des tacons 0+ ................................................ 272 49.9. Conclusion pour l’Allier ............................................................................ 274 50. Action 10 : Valorisation des connaissances et sensibilisation des acteurs 277 51. Exposition itinérante ................................................................................ 277 51.1. Présentation de l’exposition itinérante ....................................................... 277 51.1.1. Objectifs .......................................................................................... 277 51.1.2. Description et contenu ....................................................................... 277 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 6 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 51.1.3. Dispositif de prêt .............................................................................. 278 51.2. Bilan de l’année 2013 .............................................................................. 278 51.2.1. Volume des emprunts ........................................................................ 278 51.2.2. Lieux d’exposition ............................................................................. 279 51.2.3. Typologie des emprunts ..................................................................... 280 51.2.4. Coûts des emprunts .......................................................................... 284 51.2.5. Communication ................................................................................ 285 51.3. Conclusion -perspectives.......................................................................... 290 52. Réalisation de panneaux d’information et de sensibilisation sur le saumon ....................................................................................................................... 291 52.1. Contexte ................................................................................................ 291 52.2. Objectifs ................................................................................................ 291 52.3. Mise en œuvre, résultat ........................................................................... 291 52.4. Conclusion ............................................................................................. 294 53. Présentation de la plaquette Actions Phares ............................................ 295 53.1. Objectifs ................................................................................................ 295 53.2. Résultats ............................................................................................... 295 53.3. Conclusion ............................................................................................. 298 54. Conclusion générale ................................................................................. 299 54.1. Station de comptage : ............................................................................. 299 54.2. Comptage frayères de saumons : .............................................................. 302 54.3. Front de colonisation des Lamproies sur l’axe Vienne : ................................ 302 54.4. Evaluation de la reproduction des aloses en deçà des stations de comptage : . 303 54.5. Évaluation des potentialités de la Loire moyenne pour la reproduction des aloses et de la lamproie marine .................................................................................. 304 54.6. Evaluation de la proportion de lamproies en deçà des stations de comptage sur le bassin de la Vienne : ....................................................................................... 305 54.7. Cahier des charges du bon entretien des dispositifs de franchissement des ouvrages pour les poissons ............................................................................... 305 54.8. Etude comparative de la survie des œufs de saumon atlantique sur les zones de reproduction du bassin. .................................................................................... 306 54.9. Suivi par pêches électriques standardisées de la production naturelle de juvéniles de saumon et de l’implantation des juvéniles déversés. ........................................ 307 54.10. Valorisation des connaissances et sensibilisation des acteurs à la gestion des poissons migrateurs ........................................................................................ 311 55. Bibliographie ............................................................................................ 314 BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 7 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 1. DESCRIPTIF DU PROGRAMME D’ACTIONS 2013 1.1. Contexte Depuis les années 90, la prise de conscience de la baisse des effectifs de poissons grands migrateurs en France s’est traduite par la mise en place de Comités de Gestion des poissons migrateurs (COGEPOMI), instances de concertation chargées de mettre en place des plans de gestion des poissons migrateurs (PLAGEPOMI), fixant des modalités de gestion des espèces sur une durée de 5 ans (modalités de pêche, mesures utiles pour la reproduction, la circulation, le suivi, les plans d’alevinage), en lien avec les SDAGE. Sur le bassin de la Loire, le « COGEPOMI du bassin de la Loire, des cours d’eaux vendéens et de la Sèvre Niortaise » couvre en totalité ou en partie 28 départements et 9 régions administratives (Pays de la Loire, Basse-Normandie, Poitou-Charentes, Limousin, Centre, Bourgogne, Auvergne, Rhône-Alpes et Languedoc-Roussillon). Il est présidé par le Préfet de la région Pays de la Loire. Le volet « Migrateurs » du Plan Loire III est également concerné par d’autres documents stratégiques ou réglementaires entrés en vigueur après son adoption, notamment : - Le plan de gestion Anguilles, établi en application du Règlement (CE) n° 1100/2007 instituant des mesures de reconstitution du stock d’anguilles européennes et adopté par la Commission européenne le 15 février 2010. Le plan national est décliné à l’échelle des bassins. - Le plan français de préservation du saumon, validé en juin 2008 pour atteindre les objectifs définis en 2006 par l’organisation de conservation du saumon de l’Atlantique Nord (OCSAN), à laquelle adhère l’Union Européenne. Ce plan dresse un bilan de l’état des stocks de saumons dans les cours d’eau des bassins versants français, la situation des pêcheries et des captures et sur les mesures et actions actuelles en faveur de cette espèce. Sur cette base, il propose vingt actions pour améliorer la gestion des pêches, protéger et restaurer l’habitat du saumon, restaurer les stocks, mieux gérer l’aquaculture et faciliter l’échange d’informations. - L’adoption de la loi Grenelle 1, qui fait de la restauration de la continuité écologique une priorité, en lançant le concept de « trame bleue ». L’article 23 de cette loi précise en effet que, « pour stopper la perte de biodiversité sauvage et domestique, restaurer et maintenir ses capacités d'évolution », l'Etat se fixe notamment comme objectif « la constitution, d'ici à 2012, d'une trame verte et bleue, outil d'aménagement du territoire qui permettra de créer des continuités territoriales ». Ce concept sera repris dans le SDAGE 2010-2015 ; - Notons enfin que l’Union Européenne fixe comme obligation la « transparence migratoire », par l’effacement des obstacles ou la mise en place de dispositifs de franchissement sur des axes à enjeux : en effet, en application de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) de 2000, la Loi sur l’Eau et les Milieux Aquatiques (LEMA) du 30 décembre 2006 instaure la notion de continuité écologique pour les cours d’eau qui seront classés au titre de l’article L. 214-17 du code de l’Environnement. BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 8 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. Les objectifs du plan Loire sur ce thème sont formulés de la façon suivante : - « Pérenniser, voire développer le suivi des migrations et le suivi évaluatif des actions dans un cadre commun et coordonné (stations de suivi, tableaux de bord notamment Anguilles - Approfondir la connaissance et la recherche sur la biologie des espèces, et plus particulièrement sur les facteurs limitant leur restauration ». Ils correspondent à ceux du PLAGEPOMI, qui vise notamment à « améliorer la connaissance sur le statut et la dynamique des populations de poissons migrateurs et développer et pérenniser les dispositifs de suivi de ces espèces » pour mieux évaluer l’efficacité des mesures de gestion et de restauration mises en œuvre et les réorienter si nécessaire. Le PLAGEPOMI détaille les mesures de suivi transversales à mettre en œuvre pour les potamotoques, et les mesures spécifiques aux saumons, aux lamproies et aux aloses. Les plans Anguilles de bassin déclinent les mesures de suivi prévues à cette échelle. L’association LOGRAMI contribue aux mesures de « monitoring » du PLAGEPOMI, du plan Anguilles et du plan de gestion du saumon, en réalisant des recherches. Ces données alimentent les tableaux de bords Anguilles (depuis 2001) et SALT (depuis 2008) qui ont pour objet de fournir une vision dynamique des populations de façon à accompagner la décision publique pour une meilleure gestion des grands migrateurs. En partenariat avec les acteurs de la gestion des poissons amphihalins, LOGRAMI assure le pilotage des opérations d’acquisition de données biologiques à travers un volet « connaissance ». Ce programme d’acquisition de données biologiques enrichit la connaissance grâce à des séries chronologiques en adéquation avec le cycle de vie des espèces notamment par un réseau de stations de suivi. Ce dernier obtient des données précises sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire à l’entrée des axes, en terme d’état quantitatif (comptage) et qualitatif (taille, temporalité des migrations). Ce programme apporte également des éléments de compréhensions de la dynamique des espèces en s’attachant aux phases de développement déterminant de chacune d’entre elles. Ainsi, par exemple les opérations de dénombrement et de localisation des frayères de saumons atlantique, de lamproies et d’aloses sur l’Allier, la Vienne, la Creuse, la Gartempe et leurs affluents permettent d’évaluer le potentiel de reproduction. Compte tenu des enjeux pour l’espèce, le volet connaissance déploie des efforts conséquents sur le saumon atlantique. Il s’attache à préciser les facteurs limitant à tous les stades de développement :  Comptage aux passes à poissons (8 stations de comptage)  Comptage des frayères  Évaluation de la survie des œufs sur les zones de reproduction  Suivi par pêches électriques standardisées des juvéniles de saumons issus de reproduction naturelle ou de déversement Le programme de recueil de données biologiques 2013 comporte donc dix opérations complémentaires. Les différentes mesures sont déclinées sous forme de fiche par opération. BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 9 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages. 1.2. Présentation générale des actions du programme D’une manière plus détaillée :  Le suivi du réseau de stations de comptage du bassin de la Loire permet d’acquérir des données précises sur l’état des populations de poissons migrateurs sur le bassin ainsi que sur les flux migratoires. Les stations de comptage permettent d’analyser les migrations des espèces « grands migrateurs » toute l’année. L’analyse des passages annuels nous renseignera sur l’état qualitatif et quantitatif des stocks et sur les conditions de migration.  Les opérations de comptage et de repérage des frayères de saumons, aloses et lamproies permettent d'avoir un indice sur l'abondance et la répartition géographique des géniteurs au moment de la reproduction. Cette action fournit de plus des informations sur le front de migration. Cela permet d’avoir des indices sur les abondances dans les cours d’eau où aucun comptage des poissons n’est possible. Le repérage systématique des frayères permet d'établir des cartographies précises des lieux de ponte et d’estimer la reproduction naturelle. Il permet également de visualiser les effets de mesures de gestion telles que l’effacement ou l’aménagement d’ouvrage par une augmentation du linéaire colonisé.  Une cartographie des zones potentielles de reproduction de la lamproie marine et des aloses sera réalisée en Loire moyenne. Cette action permettra d’affiner les potentialités d’accueil en deçà des stations de comptage.  Faisant suite au guide du bon entretien édité en 2008, un cahier des charges d’entretien par types de passes a été réalisé afin que les gestionnaires puissent garantir le bon fonctionnement de leur dispositif de franchissement.  En complément du suivi des migrations de montaison et de fraies de saumons, l’évaluation de la survie des œufs sur les zones de reproduction doit permettre d’évaluer la fonctionnalité des différents secteurs de reproduction de la Sioule pour le saumon atlantique. L’indicateur recherché est le taux de survie sous gravier et plus précisément le taux de survie entre l’œuf fécondé et l’alevin émergent.  Le suivi par pêches électriques des juvéniles de saumon permet de connaître la production naturelle de juvéniles et la survie jusqu’au stade tacon, la survie des juvéniles déversés au stade alevin et de vérifier la fonctionnalité des zones favorables aux juvéniles.  La dernière action concerne la valorisation des informations recueillies auprès des acteurs du bassin et une sensibilisation des acteurs à la problématique des poissons. BACH J.M., PAROUTY T., LEON C., SENECAL A., PORTAFAIX P., RIVARD Q., BARAULT A. & BAISEZ A., 10 - Recueil de données biologiques sur les populations de poissons migrateurs du bassin de la Loire, 2013. LOGRAMI, 2014 : 319 pages.