Bologna 31 Agosto - 3 Settembre 2015 6° Congress of the Italian Society of Evolutionary Biology SIBE-ISEB Conference program st rd Bologna,  August  31  –  September  3  2015       Evoluzione  2015   6°  Congress  of  the  Italian  Society  of   Evolutionary  Biology   SIBE-­‐ISEB         Conference  program   -­‐  I  -­‐ st   Monday,  August  31 ____________________________________________________________________________________________   14:00-­‐14:20   Conference  opening  and  welcome     Symposium  1   Evolution  of  Genomes  and  Genomic  Conflicts   Chair:  Marco  Passamonti     14:20  –  15:00   William  F.  Martin.  Endosymbiotic  origin  and  differential  loss  of  eukaryotic  genes.   Invited  speaker   15:00  –  15:20   Michele   Castelli.   Insights   on   the   evolution   of   the   bacterial   endosymbiont   Holospora  caryophila  from  the  genome  sequence.   15:20  –  15:40   Rupinder  Kaur.  Investigating  the  genotypic  and  phenotypic  basis  of  continental   specific  Drosophila-­‐Wolbachia  endosymbiotic  system.   15:40  –  16:00   Fabrizio   Ghiselli.   The   Doubly   Uniparental   Inheritance:   a   model   system   for   studying  evolutionary  and  functional  genomics  of  mitochondria.   16:00  –  16:20   Liliana   Milani.   Mitochondrial   activity   in   gametes   and   transmission   of   viable   mtDNA.   16:20  –  16:40   Saverio   Vicario.   Evidence   for   purifying   selection   of   mtDNA   mutations   during   human  oogenesis.   16:40  –  17:00   Federico  Plazzi.  100  of  these  genomes:  Bivalve  mitogenomics  hits  triple  digits.     Coffee  break   17:20  –  17:40   Andrea  Luchetti.  Recombine  and  survive:  evolutionary  history  of  the  V  highly   conserved   domain   in   the   mammalian   genome   after   the   V-­‐SINE   superfamily   extinction.   17:40  –  18:00   Livia  Bonandin.  Reproductive  biology  versus  transposable  elements  load:  the  role   of  host  reproductive  strategy  in  the  study  of  R2  dynamics  in  Bacillus  stick  insects   (Phasmida,  Bacillidae).   18:00  –  18:20   Chiara  Pontremoli.  Adaptive  evolution  underlies  the  species-­‐specific  binding  of  P.   falciparum  RH5  to  human  basigin.   18:20  –  18:40   Emiliano  Trucchi.  Epigenetic  divergence  and  parallel  adaptation  in  Heliosperma   pusillum  (Caryophylaceae).   18:40  –  19:00   Francesca   Dumas.   Interstitial   telomeric   sequences   distribution   in   eight   Neotropical   primates   (Platyrrhinae)   by   (TTAGGG)n   probe   mapping:   interstitial   location  and  their  possible  role  in  evolution               -­‐  II  -­‐ st Tuesday,  September  1   _______________________________________________________________________________________   Symposium  2   Evolutionary  Research  in  Museums.   Chair:  Franco  Andreone     08:40  –  09:20   Angelica   Crottini,   Franco   Andreone.   When   traditional   museological   tools   Invited  speaker   meet   new   cutting-­‐edge   applications:   our   experience   with   the   study   of   species  diversification  patterns,  taxonomy  and  conservation  of  Madagascar   herpetofauna.   09:20  –  09:40   Leonardo  Latella.  The  tale  of  specimen:  what  and  when  natural  history  collections   can  tell  us  about  evolution.   09:40  –  10:00   Elena  Canadelli.  The  “Extinction”  project:  valorisation  of  museum  natural  history   collections  as  a  tool  to  link  research,  outreach  and  conservation.   10:00  –  10:20   Giovanni  Forcina.  Unravelling  the  biogeography  of  secretive  taxa  by  museum   collections:   the   untold   story   of   the   black   francolin   (Francolinus   francolinus,   Phasianidae)  in  the  Mediterranean.     Coffee  break   10:40  –  11:00   Agostino  Leone.  Restoring  the  history  of  sawfish  in  the  Mediterranean  from   museum  exhibits.   11:00  –  11:20   Francesco  Massari.  Unlocking  the  evolutionary  history  of  the  mighty  bluefin  tuna   using  novel  paleogenetic  techniques  and  ancient  tuna  remains.     Symposium  3   Phylogenetics,  Biogeography  and  Phylogeography   Chairs:  Gabriele  Gentile,  Saverio  Vicario     11:20  –  12:00   Alexandre  Antonelli.  The  evolution  of  neotropical  mega-­‐diversity.   Invited  speaker   12:00  –  12:20   Laura   Parducci.   Inferring   past   tree   distribution   in   Nordic   environments   from   ancient  DNA.   12:20  –  12:40   Daniela   Lucente.   The   role   of   local   refugia   and   paleoclimatic   history   in   the   phylogeography   of   a   cold-­‐tolerant   species:   the   European   cave   salamander   Hydromantes  strinatii   12:40  –  13:00   Fausto  Tinti.  Molecular  markers,  natural  history  and  evolution  in  sharks  and  rays.     Lunch   14:40  –  15:00   Giulia  Fassio.  Unexpected  biodiversity  of  epizoic  gastropod  genus  Marseniopsis   (Velutinidae)  within  a  phylogenetic  framework  for  the  family.   15:00  –  15:20   Mukesh  Thakur.  Problem  bear  translocation:  is  it  effective  management  practice   to  mitigate  bear-­‐human  conflicts  in  Dachigam  landscape,  Jammu  and  Kashmir,   India?   15:20  –  15:40   Matteo  Vecchi.  A  backboned  phylogeny  for  invertebrates:  the  case  and  problems   of  eutardigrades  (Tardigrada)   15:40  –  16:00   Massimo  Bernardi.  Species  between  conservation  and  evolution.   -­‐  III  -­‐ Symposium  4   Evolution  of  phenotypes  and  Organismal  Biology   Chairs:  Omar  Rota  Stabelli,  Lino  Ometto     16:20  –  17:00   Benjamin   Proud’Homme.   Regulatory   evolution   and   the   diversification   of   pigmentation  patterns  in  Drosophila.   Invited  speaker   17:00  –  17:20   Silvia  Paolucci.  Maternal  effect  on  offspring  size  in  seed  harvester  ants.     17:20  –  17:40   Federica  Costantini.  Genetic  connectivity  along  depth  gradient  and  implications  for   phenotypic  plasticity  in  a  gorgonian  species.   17:40    –  18:00   Ilaria  Giovannini.  The  phenotypic  plasticity  in  life  history  traits  of  an  Antarctic   water  bear  as  a  strategy  to  cope  with  extreme  environmental  conditions.   18:00  –  18:20   Sukanya  Ramasamy.  The  role  of  olfaction  in  the  making  of  a  pest  -­‐  a  genomic   analysis.     19:30  –  22:00   The  Evolution  of  the  Aperitif.  Zoology  Museum,  via  Selmi  3.     nd Wednesday,  September  2   _______________________________________________________________________________________   Symposium  5   Population  Genetics  and  Genomics   Chairs:  Giorgio  Bertorelle,  Paolo  Ajmone  Marsan     09:00  –  09:40   Konrad  Lohse.  Inferring  population  histories  from  genomes.   Invited  speaker   09:40  –  10:00   Carlo  Pecoraro.  The  application  of  2b-­‐RAD  approach  for  investigating  the  genomic   population  structure  of  yellowfin  tuna  (Thunnus  albacares)  at  the  global  scale.   10:00  –  10:20   Pierpaolo  Maisano  Delser.  Population  genomics  of  C.  melanopterus  using  target   gene  capture  data:  demographic  inferences  and  conservation  perspectives.   10:20  –  10:40   Luca  Calderoni.  Regressive  evolution  in  Somalian  cavefish  Phreatichthys  andruzzii:   loss  of  selective  constraint  on  opsin  genes.     Coffee  break   11:00  –  11:20   Livia   Di   Giambattista.   Population   genetics,   ecology,   and   evolution   of   the   troglophilic  isopod  Androniscus  dentiger  from  the  Frasassi  cave  system.   11:20  –  11:40   Stefano  Mona.  On  the  role  played  by  the  carrying  capacity  and  the  ancestral   population  size  during  a  range  expansion.   11:40  –  12:00   Mukesh   Thakur.   Hearing   hangul   calls   for   survival:   conservation   genetics   and   demographic  history  of  the  last  surviving  population  of  red  deer  in  India.   12:00  –  12:20   Sara  Knight.  Quantifying  separation  and  similarity  in  a  Saccharomyces  cerevisiae   metapopulation.   12:20  –  12:40   Giorgio  Bertorelle.  The  evolution  of  the  small  and  isolated  population  of  Apennine   brown  bears  (Ursus  arctos  marsicanus):  a  whole-­‐genomes  perspective.     -­‐  IV  -­‐ Lunch     Symposium  6   Evolutionary  Applications   Chair:  Giorgio  Binelli     14:20  –  15:00   Berthold  Heinze.  Genetic  analysis  and  real  world  problems  in  ecology  and  forestry.   Invited  speaker   15:00  –  15:20   Vincent  Piou.  Importance  of  the  phoretic  phase  in  the  reproduction  of  Varroa   destructor:  ectoparasite  of  the  honey  bee  (Apis  mellifera).   15:20  –  15:40   Omar  Rota  Stabelli.  Evolution  and  genomics  quickly  provide  with  useful  clues  for   insect  pest  management:  the  case  of  Drosophila  suzukii.   15:40  –  16:00   Isabella  Vanetti.  Taxonomy  and  genetic  diversity  of  anodontine  mussels  in  Lake   Maggiore.   16:00  –  16:20   Caterina  Maria  Antognazza.  Genetics  survey  of  European  barbel  (Barbus  barbus)   populations  in  England  and  Wales:  implication  for  future  restocking  management.   16:20  –  16:40   Emanuele  Fasola.  Frogs’  microbiome  from  metal  polluted  and  metal  non-­‐polluted   sites.   16:40  –  17:00   Anna  Sandionigi.  Next-­‐gen  monitoring  strategies.  A  warning  system  for  EXPO2015.         17:00  –  17:20   Giacinto  Libertini.  Evolutionary  classification  of  diseases  and  similar  conditions.     SIBE  Lecture     17:40  –  18:20   Pietro  Omodeo.  Every  evolutionary  step  is  an  addition  of  information  to  an   already  existing  system.     18:20  –  19:40   SIBE  Members  Meeting     21:00  –  24:00   Social  Dinner     rd Thursday,  September  3   _______________________________________________________________________________________   Symposium  7   New  Frontiers  in  Evolutionary  Anthropology*   Chair:  Silvia  Ghirotto   *  Co-­‐hosted  with  the  Italian  Anthropological  Association     09:30  –  10:30   Eske  Willerslev.  How  we  settled  the  world  and  developed  our  culture.   Invited  speaker   10:30  –  10:45   Francesca  Tassi.  Early  modern  human  dispersal  from  Africa:  genomic  evidence  for   multiple  waves  of  migration.   10:45  –  11:00   Daniele  Gibelli.  Identification  of  missing  children:  a  quantitative  approach  to  the   -­‐  V  -­‐ analysis  of  facial  morphology.   11:00  –11:15   Elisabetta   Cilli   Discovering   past   gut   microbiomes   through   NGS   analysis:   the   mummies  of  Roccapelago  (MO).     11:15  –  11:30   Discussion     Coffee  break   11:45  –  12:00   Cristina   Giuliani.   DNA   methylation   variability   along   the   Italian   peninsula:   an   evolutionary  perspective  reveals  implications  for  human  health  and  diseases.   12:00  –  12:15   Elena  Fiorin.  The  significance  of  microfossils  recovered  from  dental  calculus  for   anthropological  analysis.   12:15  –  12:30   Michela  Leonardi.  Testing  for  the  influence  of  lifestyle  on  genetic  diversity  through   time.   12:30  –  12:45   Discussion       -­‐  VI  -­‐ Posters     n.   Author                                                                                            Title                                                                                                                        Symposium     1.   Stefano  Bettinazzi   The  complete  female-­‐  and  male-­‐transmitted  mitochondrial  genome   1   of  Meretrix  lamarckii  (Bivalvia:  Veneridae)   2.   Davide  Guerra   The  tangled  triangle  among  ORFans,  mitochondrial  inheritance,  and   1   sex   determination:   mtDNA   evolution   at   the   root   of   Paleoheterodonta  (Bivalvia)   3.     Alessandro  Laurenzi   A  study  of  Sex-­‐Bias’  effects  on  evolution  and  sex  determination   1   4.     Andrea  Pecci   Endogenized  mitochondrial  gene  expressed  in  the  germ  line   1   5.     Valentina  Peona   Comparison  of  the  transposable  elements  dynamics  among  taxa   1   with  different  rates  of  speciation   6.     Claudia  Scavariello   First  case  of  R2  non-­‐LTR  retrotransposon  horizontal  transfer:  data   1   from  Bacillus  stick-­‐insects  genome  (Insecta  Phasmida).   7.     Michela  Pacifico   Successful  sequencing  of  Huntington’s  disease  CAG  microsatellite   2   orthologs  from  museum  collection  specimens     8.     Daniela  Minelli   Understanding  the  rise  of  modern  elasmobranchs  and  predator-­‐ 2   prey  interactions  in  ancient  coral  reef  food  web:  an  example  of   research  in  scientific  museums.   9.     Saverio  Vicario   Across  the  shifting  baselines  -­‐  measuring  change  in  biodiversity  in   2   the   sea   benthos   of   the   Kattegat   across   70   years   and   different   sampling  technology   10.   Federica  Costantini   Between   Scylla   and   Charybdis:   differential   genetic   patterns   in   3   Eastern  and  Western  Mediterranean  Patella  caerulea  populations   11.   Samanta  Michelini   Bifidobacterium  spp.  from  non  human  primates:  a  source  of  novel   3   species   12.   Vito  Scicchitano   Phylogeography  and  colony  structure  of  dry-­‐wood  dwelling  termites   3   of   the   genus   Kalotermes   (Isoptera,   Kalotermitidae)   in   Southern   Europe   13.     Saverio  Vicario   Predictive  dating  of  the  Plum  pox  virus  evolution  indicates  a  recent   3   appearance  of  main  recombinant  strains.   14.   Gianluca  Zuffi   Definition  of  three  distinct  taxa  within  the  Barbus  species  complex   3   15.   Elisabetta  Versace   Olfactory   responses   in   Drosophila   suzukii   and   Drosophila   4   melanogaster:  a  comparative  study   16.   Andrea  Benazzo   Using  ABC  and  microsatellite  data  to  detect  multiple  introductions   5   of  invasive  species  from  a  single  source   17.   Lino  Ometto   Genome  sequencing  galore:  what,  how  and  why   5   18.   Elisa  Bellucci   The  process  of  domestication  in  common  bean   6   19.   Giorgio  Binelli   Genetic   survey   of   the   Cistus   albidus   populations   in   Western   6   Mediterranean   20.   Andrea  Brunelli   Maternal  history  of  Southeast  Asia  and  Oceania   7   21.   Roberta  Rosa  Susca   Y-­‐chromosome   and   mtDNA   diversity   in   the   context   of   Eurasian   7   language  diversity     -­‐  VII  -­‐ 22.   Filippo  Barbanera   Molecular  phylogeography  of  the  smooth-­‐coated  otter  (Lutrogale   8   perspicillata,  Mustelidae)  for  its  conservation  in  the  Mesopotamian   marshes  of  Iraq     23.   Michele  Cesari   Brown   marmorated   stink   bugs   are   invading   Europe:   potential   8   pathways  of  origin  of  the  alien  pest  populations  of  Halyomorpha   halys  (Heteroptera,  Pentatomidae)   24.   Cristina  Crava   The   taste   of   Drosophila   suzukii:   phylogeny   and   evolution   of   its   8   gustatory  receptors   25.   Silvia  Fuselli   The  study  of  MHC  variation  and  evolution  in  the  Alpine  chamois:   8   from  targeted  Sanger  sequencing  to  portable  nanopore  technology   (MinION)   26.   Mariangela  Iannello   A  transcriptome  annotation  pipeline  for  non-­‐model  organisms   8   27.   Costanza  Piccoli   Wikipedia:   with   great   power   comes   great   (evolutionary)   8   responsibility     -­‐  VIII  -­‐ -­‐  IX  -­‐