BTS analyses de Biologie médicale Architecture des programmes Discipline modules intitulé théorie AT CCF Biochimie 1 Biochimie structurale x 2 analyse instrumentale x 1ère année 3 enzymologie x x 1ère année 4 biologie cellulaire x 5 biologie moléculaire x x 1ère année 6 Métabolisme x 7 Immuno-analyse x 2ème année 8 Biochimie clinique x x 2ème année Microbiologie 1 bactériologie générale x 2 Méthodes d'analyse en bactériologie x 1ère année 3 Bactériologie systématique x x 1ère année 4 Microbiologie médicale x x 2ème année 5 Virologie x x 2ème année 6 Mycologie x x 2ème année 7 Parasitologie x x 2ème année Hématologie 1 Cytologie sanguine et médullaire x x 1ère année 2 Hémopathies x x 2ème année 3 Hémostase x x 2ème année 4 Immuno-hématologie x 1ère année Anatomopathologie unique x x 2ème année Immunologie 1 Antigénes anticorps x 2 Réaction Ag-Ac in vitro x x en situation 3 Mécanisme de l'immunité x 4 Expression de le réponse immunitaire x BTS analyses de Biologie médicale Biochimie : Horaires indicatifs enseignement théorique et activités technologiques Module 1 Biochimie structurale Première année Enseignement théorique Nombre d’heures 1- Constituants chimiques de la matière vivante 5 h 2- Protides 17 h 3- Glucides 7 h 4- Lipides 5 h 5- Bases nucléiques et nucléotides 2 h Total 36 h (4 h x 9) 9 semaines Module 2 Analyse instrumentale Première année Activités technologiques Nombre de séances 1- Méthodes volumétriques 4 2- Méthodes électrométriques 2 3- Méthodes optiques 7 4- Méthodes de fractionnement 5 5- Méthodes automatiques 1 Total 19 semaines Module 3 Enzymologie Première année Enseignement théorique Nombre d’heures 1- Caractéristiques générales de la réaction enzymatique 4 h 2- Cinétique michaelienne 6 h 3- Coenzymes 3 h 4- Enzymes allostériques 2 h 5- Applications à l’analyse médicale 9 h Total 24 h (4 h x 6) 6 semaines Activités technologiques Nombre de séances 1- Dosage d'enzyme 4 2- Dosage de substrat 3- Electrode à enzyme Total 4 semaines Module 4 Biologie cellulaire Première année Enseignement théorique Nombre d’heures 1- Organisation générale d’une cellule animale 4 h 2- Membranes cellulaires 5 h 3- Transferts membranaires 5 h 4- Communication cellulaire 6 h Total 20 h (4 h x 5) 5 semaines Module 5 Biologie moléculaire Première année Enseignement théorique Nombre d’heures 1- Génome et expression des gènes 9 h 2- Outils et techniques de la biologie moléculaire 10 h 3- Applications à la biologie médicale 5 h Total 24 h (4 h x 6) 6 semaines Activités technologiques Nombre de séances 1- Extraction, quantification 2- Electrophorèse 3- PCR 3 Total 3 semaines Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 2 sur 16 Horaires Biochimie Module 6 Métabolisme Seconde année Enseignement théorique Nombre d’heures 1-Métabolisme énergétique Bioénergétique (4 h) 14 h Voies du métabolisme énergétique (10 h) 2- Autres voies du métabolisme glucidique 2 h 3- Autres voies du métabolisme lipidique 2 h 4- Métabolisme azoté 2 h Total 20 h (2 h x 10) 10 semaines Module 7 Immuno-analyse Seconde année Activités technologiques Nombre de séances 1- Immuno-enzymologie (compétition, sandwich) 2- Immunochromatographie 3- Immunoprécipitation 5 Total 5 semaines Module 8 Biochimie clinique Seconde année Enseignement théorique Nombre d’heures 1- Exploration fonctionnelle rénale 5 h 2- Exploration du métabolisme hydro-électrolytique 5 h 3- Exploration du métabolisme phospho-calcique 3 h 4- Exploration de l’équilibre acido-basique et des gaz du sang 4 h 5- Exploration des diabètes 4 h 6- Exploration des protéines plasmatiques 3 h 7- Exploration des lipides plasmatiques 4 h 8- Exploration fonctionnelle hépatique 3 h 9- Exploration de la fonction thyroïdienne 2 h Total 32 h (2 h x 16) 16 semaines Activités technologiques Nombre de séances 1- Etude d’un coffret de dosage 1 2- Comparaison des méthodologies 2 3- Exploration fonctionnelle rénale 2 4- Exploration de l’équilibre hydro-électrolytique 2 5- Exploration du métabolisme phosphocalcique 2 6- Exploration du pH et des gaz du sang 1 7- Exploration fonctionnelle hépatique 2 8- Dépistage et suivi du diabète 2 9- Exploration des protéines plasmatiques 2 10- Exploration du métabolisme du fer 1 11- Exploration des lipides plasmatiques 2 12- Infarctus du myocarde 1 13- Exploration en hormonologie 1 Total 21 semaines Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 3 sur 16 Horaires Biochimie BTS analyses de Biologie médicale BIOCHIMIE - Repères pour la formation Module 1 – Biochimie structurale Il est possible de traiter les modules par parties. Référentiel Précisions 1.2.3. On donnera les notions de pression osmotique et de Définir et savoir appliquer la formule de calcul de la force ionique d’une solution pression osmotique et de la force ionique. 2.1. On développera plus particulièrement les propriétés L’étudiant doit savoir reconnaître les formules semi- des acides aminés naturels présentant un intérêt développées des vingt acides aminés protéinogènes. analytique Propriétés à traiter : ionisation, solubilité, polarité, absorption de la lumière et réaction à la ninhydrine. 3. L’étude des propriétés physiques et chimiques des Ce commentaire s’applique à la totalité du paragraphe 3 « oses et des osides … Glucides ». 3.1.1. Structure, propriétés et classification des oses Structures à connaître : glycéraldéhyde, dihydroxyacétone, ribose, glucose, fructose, galactose. Propriétés à traiter : solubilité, caractère réducteur, réactions furfuraliques (chromatographie sur couche mince). 3.2.3. On choisira comme exemples des polyhosides… Lire : « polyosides ». 3.2.5 Esculine L’exemple de l’esculine n’est pas à traiter obligatoirement. 4.1.1. Structure des acides gras naturels À partir de la nomenclature officielle, l’étudiant doit savoir écrire la formule semi-développée d’un acide gras. Mentionner également la nomenclature utilisée en nutrition. Se limiter à montrer que la structure des prostaglandines On donnera des exemples d’acides gras... et des thromboxanes dérive de l’acide arachidonique. Lire : Alcools : glycérol, cholestérol, alcools gras, 4.1.2. Alcools : Icohols …. sphingosine. Ajouter : « On donnera leur définition et leurs 4.2. Lipides simples caractéristiques structurales ». Montrer la nature isoprénique des vitamines A,D, E, K, de On abordera succinctement les vitamines A, D, E, 4.4. l’ubiquinone, des acides biliaires et des hormones K. stéroïdes. Reconnaître le caractère purique ou pyrimidique des 5.1. Molécules constitutives bases. L’étude porte bien sur les nucléosides et nucléotides en général, y compris ATP et NAD. 5.2. Nucléosides et nucléotides Les propriétés spectrales concernent les coenzymes NAD et NADP. Module 2 – Analyse instrumentale 2.1. pH-métrie Les bases théoriques de la réalisation des solutions tampons sont traitées en Sciences physiques et chimiques. 3.5. Contrôle de qualité d’un spectrophotomètre Pour le contrôle de la thermostatisation, il s’agit de sensibiliser les étudiants à l’importance du paramètre température sur le résultat des mesures notamment de cinétique enzymatique. 4.1. Centrifugation Les bases théoriques de la centrifugation sont traitées en Sciences physiques et chimiques. Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 4 sur 16 Repères Biochimie 4.2.1. Chromatographie sur couche mince L’objectif étant de mettre en évidence les facteurs intervenant dans la séparation chromatographique, cette technique peut également être réalisée avec des acides aminés. 4.2.4. Chromatographie liquide haute performance Remplacer « on réalisera » par « on pourra réaliser » une chromatographie. 4.3. On citera l’électrophorèse capillaire Présenter le principe simplifié et donner des exemples d’application. Module 3 – Enzymologie – Enseignement théorique 2.1. Représentations graphiques Traiter au minimum Michaelis-Menten et Lineweaver-Burk 2.3. Les représentations graphiques des inhibitions Se limiter à l’inhibition compétitive. 3. On présentera la structure des principaux Présenter au minimum : ATP, NAD/NADP, FAD et coenzymes coenzyme A. 4. On définira l’allostérie … Présenter la structure oligomérique des enzymes allostériques, le phénomène de coopérativité, l’allure sigmoïde (coopérativité positive) et l’existence d’effecteurs allostériques. 5.2.1. Dosage de substrats On décrira les méthodes de dosage, point final et cinétique, avec une ou plusieurs enzymes. Module 4 – Biologie cellulaire 4.2 On évoquera les cytokines, hormones et Définir les trois types de communication : autocrine- neurotransmetteurs paracrine, endocrine et neurocrine. Module 5 – Biologie moléculaire 2. Outils et techniques de la biologie moléculaire Le terme présenter peut correspondre à une définition, un exemple significatif, un schéma explicatif…. Module 6 - Métabolisme Il est intéressant de démarrer la biochimie clinique (module 8) en début de seconde année. Il n’est pas indispensable d’avoir traité tout le métabolisme (module 6) pour aborder la biochimie clinique (module 8). Il est donc possible d’imbriquer les modules 6 et 8. 1.2.1. La glycolyse, la fermentation lactique, la L’étudiant doit savoir compléter un schéma représentatif décarboxylation oxydative du pyruvate devront être de la glycolyse avec les noms des molécules, des connues coenzymes, des enzymes. Ne pas traiter le mécanisme détaillé de la décarboxylation oxydative du pyruvate. On présentera le cycle de Krebs L’étudiant doit savoir repérer sur un schéma du cycle de Krebs les étapes de déshydrogénation, de décarboxylation, de phosphorylation. On détaillera la β-oxydation des acides gras saturés L’étudiant doit savoir repérer sur un schéma représentatif à nombre pair d’atomes de carbone d’un tour d’hélice de Lynen les étapes de déshydrogénation, hydratation et lyse. 1.2.2. Pour ces voies métaboliques, on précisera la Présenter succinctement ces voies métaboliques (formule localisation tissulaire, on établira le bilan …. développée de l’UDPG non exigée). 1.2.3 Néoglucogenèse Présenter les trois étapes caractéristiques de la néoglucogenèse à partir du pyruvate. Situer les niveaux d’entrée des substrats suivants : lactate, alanine et aspartate, glycérol. Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 5 sur 16 Repères Biochimie 2.1 Voie des pentoses phosphates L’étudiant doit connaître les deux principaux intérêts de cette voie métabolique et savoir écrire la première étape (G6PDH). 4.1 Protéolyse Donner : -l’équation d’hydrolyse de la liaison peptidique, -les localisations de la protéolyse, -des exemples de protéases et leur spécificité. 4.3 Uricogenèse Indiquer l’origine purique de l’acide urique. Présenter succinctement cette voie métabolique en faisant le lien avec les pathologies associées. Module 7 - Immunoanalyse 1. Immuno-enzymologie Il est possible de doser un autre analyte qu’une hormone. Module 8 – Biochimie clinique – Enseignement théorique Il est recommandé d’envisager la progression des activités technologiques de manière à être en phase avec l’enseignement théorique. Certaines analyses doivent être réalisées en relation avec l’hématologie : dosage du fer, immunofixation. 1.2. Principales pathologies rénales Se limiter à l’insuffisance rénale et au syndrome néphrotique. 3.2. Principaux troubles du métabolisme phospho- Se limiter aux définitions et à quelques manifestations calcique cliniques. 4.1.3. Notions sur la régulation de la ventilation pulmonaire Se limiter à la présentation de la boucle régulatrice (chémorécepteurs, centres bulbaires, voie nerveuse, muscles respiratoires) 4.2. Désordres de l’équilibre acido-basique Définir acidose et alcalose. Expliquer l’origine métabolique ou respiratoire de ces troubles et leur compensation éventuelle. 5.1.1. Digestion des glucides Présenter schématiquement la digestion de l’amidon et des diholosides. Présenter l’absorption intestinale du glucose, en liaison avec le cours de biologie cellulaire. 5.2. Diabète insulino-dépendant et diabète non insulino- Présenter les deux types de diabètes : origines, dépendant manifestations biologiques et/ou cliniques. 6.1. Protéines plasmatiques Présenter les protéines plasmatiques sous forme d’un tableau. Les valeurs numériques ne sont pas à connaître. 7.1.1. Digestion des lipides Présenter schématiquement la digestion et l’absorption intestinale des triglycérides 7.2.1. Classification des dyslipoprotéinémie Montrer le tableau de classification des hyperliprotéinémies 7.3. Maladies cardio-vasculaires Définir les deux pathologies et présenter succinctement les facteurs de risques et les moyens de prévention. 9.2. Hyper et hypothyroïdies Présenter sommairement les manifestations cliniques. Activités technologiques 8. Il faut absolument commencer par la détermination de la Dépistage et suivi du diabète glycémie Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 6 sur 16 Repères Biochimie BTS analyses de Biologie médicale Microbiologie Horaires indicatifs enseignement théorique et activités technologiques & Repères pour la formation Module 1 Bactériologie générale Première année Théorie Pratique Enseignement théorique Repères pour la formation Place dans le monde vivant.Notions de saprophytisme, 1. Introduction commensalisme,symbiose. 2 h Composition et rôles des flores commensales. Ne présenter que des "modèles simplifiés" à l'exception de la 2. Structure 5 h paroi dont l'étude sera détaillée. Aborder dans cette partie les notions de besoins élémentaires, 3 . Nutrition . métabolisme besoins spécifiques, besoins énergétiques en lien avec les 4 h activités technologiques du module 2 . Présenter un schéma simplifié de la relation gène . protéines 4 . Génétique bactérienne permettant le lien génotype - phénotype. Présenter les propriétés des plasmides et des transposons nécessaires à la compréhension du phénomène de transfert de gènes de résistance aux antibiotiques. 4 h Présenter succinctement le phénomène de transduction spécialisée et de bactérie lysogène. Présenter succinctement les différents types de mutation en lien avec la fréquence d'apparition. Montrer l'évolution de la taxonomie phénotypique vers la 5 . Taxonomie taxonomie génotypique, à l'aide d'un exemple, tel que celui du 3 h genre Pseudomonas Pour les méthodes de biologie moléculaire : se contenter de les citer, d'indiquer leur intérêt et leur limite dans le cadre de leur application à l'identification génotypique. Lors de la présentation des mécanismes de résistance aux 6 . Agents antibactériens 6 h antibiotiques, évoquer la notion de niveau de résistance. Insister sur la notion de pouvoir pathogène spécifique de 7 . Pouvoir pathogène des bactéries bactéries pathogènes telles que Salmonella, Shigella, 4 h Chlamydia, gonocoques… Pour les bactéries opportunistes la notion de "terrain" sera développée dans le chapitre 8 Profiter de la présentation des voies de transmission des 8 . Infections communautaires et bactéries pathogènes pour présenter la démarche d'évaluation 2 h nosocomiales des risques biologiques. Total cours module 1 15 séances de 2 heures 30 h Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 7 sur 16 Microbiologie Module 2 Méthodes d'analyse en bactériologie Première année Théorie Pratique Activités technologiques Repères pour la formation 1 . Présentation des analyses dans 4 h laboratoire Les colorations fondées sur le principe de l'acido.alcoolorésistance seront réalisée lors de l'étude des 2 . Etude morphologique des mycobactéries en deuxième année, (coloration de bactéries et examens 12 h ZIEHL.Neelsen, Degommier, …). Les colorations de spores microscopiques peuvent être réalisées sur des bactéries anaérobies strictes du genre Clostridium. 3 . Isolement et étude 4 h macroscopique des bactéries 4 . Milieux de culture En lien avec le chapitre 3 du module 1, chercher à mettre en 4.1 Nutrition et milieux de culture évidence l'aspect nutritionnel des milieux de culture. Traiter en 8 h particulier la notion d'exigence nutritionnelle. Ces séances seront l'occasion d'introduire l'utilisation des milieux 4.2 Isolement et identification sélectifs en vue d'une démarche d'identification d'une bactérie 24 h pathogène à partir d'un produit pathologique 5 . Antibiogramme et contrôle de 8 h qualité Total A.T. module 2 14 séances de TP de 2 X 2 heures 60 h Module 3 Systématique bactérienne Première année Théorie Pratique Enseignement théorique Repères pour la formation Pour les entérobactéries comme pour l'ensembe des familles et genres bactériens cités dans le module 3, effectuer une étude complète (caractères bactériologiques, pouvoir pathogène, 1 . Enterobacteriaceae 7 h physiopathologie). Insister sur les genres et espéces les plus fréquemment rencontrées en pathologie humaine en particulier E.coli, Salmonella, Shigella . Etudier la sensibilié aux β-lactamines : phénotype sauvage et phénotypes de résistance (pénicillinase, BLSE...). Insister sur Vibrio, développer la physiopathologie du choléra : 2 . Vibrio, Aeromonas structure et mode d'action de la toxine .Ne pas traiter la 3 h sensibilité aux antibiotiques. Montrer la place particulière de P.aeruginosa au sein de ce 3 . Pseudomonas, Burkholderia, groupe, et développer ses facteurs de pathogénicité. Insister 3 h Stenotrophomonas sur la notion de niveau de résistance élevé aux antibiotiques. Montrer que ce genre est essentiellement rencontré dans les 4 . Acinetobacter infections nosocomiales. Insister sur la notion de niveau de 1 h résistance élevé aux antibiotiques. Distinguer S.aureus et les staphylocoques à coagulase négative. Pour S.aureus développer les différents types d'infection , 5 . Staphylocoques 5 h facteurs de pathogénicité, substances secrétées, sensibilité aux antibiotiques et place dans les infections nosocomiales. L'espèce Streptococcus pneumoniae ne sera traitée qu'en deuxième année. Concernant Enterococcus, on insistera sur le 6 . Streptococcus . Enterococcus 4 h niveau de résistance aux aminosides en lien avec l'association aux β-lactamines. total cours module 3 11 séances de 2 heures 22 h Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 8 sur 16 Microbiologie Module 3 Systématique bactérienne première année Théorie Pratique Activités technologiques repères pour la formation On peut consacrer 3 séances aux entérobactéries, en lien avec le cours de systématique (Salmonella, Shigella, E.coli, Proteus, 1 . Bacilles à Gram négatif non KES, Yersinia), deux séances Pseudomonas et apparentés 28 h exigeant ainsi que Acinetobacter (bactéries de l'hospitalisme), une séance Vibrio, Aeromonas. Pour les entérobactéries lors de la réalisation de l'antibiogramme, on mettra en évidence pour les β.lactamines la notion de phénotype sauvage (quatre types différents) et de phénotype de résistance (pénicillinase, BLSE...). Pour les Pseudomonas et Acinetobacter l'antibiogramme est à réaliser. Lors de la réalisation de l'antibiogramme, mettre en évidence les 2 . Staphylocoques trois phénotypes de S.aureus par rapport à la sensibilité aux (cid:1)− 8 h lactamines. lnsister sur la notion de multirésistance des SARM. Réaliser l'antibiogramme. Concernant Enterococcus, insister 3 . Streptococcus . Enterococcus sur le niveau de résistance aux aminosides en lien avec 8 h l'association aux β-lactamines. Total A.T. module 3 11 séances de TP de 2 X 2 heures 44 h TOTAL cours première année 52 h TOTAL A.T. première année 104 h Module 3 Systématique bactérienne Seconde année Théorie Pratique Enseignement théorique Repères pour la formation Traiter en seconde année le cas de Streptococcus pneumoniae 6. Streptococcus, Enterococcus 1 h et insister sur sa sensibilité à la pénicilline. Pour les groupes suivants on ne traitera pas la sensibilité aux antibiotiques Développer essentiellement Neisseria gonorrhoeae et Neisseria 7. Neisseria . Branhamella 3 h meningitidis Concernant Haemophilus, présenter les espèces du genre 8. Haemophilus. Pasteurella 3 h Haemophilus, et développer H.influenzae. Concernant Pasteurella, ne présenter que l'espèce multocida Présenter les espéces du genre Bordetella et développer Bordetella 1 h B.pertussis. Présenter les espéces du genre Legionella et développer Legionella 2 h L.pneumophila. Présenter les espéces du genre Corynebacterium et développer 9 . Corynebacterium, Listeria 3 h C.diphteriae. Concernant Listeria, ne présenter que l'espèce monocytogenes 10 . Campylobacter Ne développer que C.jejuni 1 h Parmi les Clostridium, insister sur C.perfringens et C.difficile. 11 . Bactéries anaérobies strictes Etudier B.fragilis. Ne pas faire une étude détaillée de 5 h C.botulinum et C.tetani Etudier de façon détaillée les bacilles tuberculeux. Aborder 12 . Mycobacteriaceae l'étude des mycobactéries atypiques les plus fréquemment 5 h rencontrées. Ne pas faire une étude détaillée de M.leprae 13 . Spirochetaceae 2 h 14 .Mycoplasmes et Chlamydiae 4 h Total cours module 3 15 séances de 2 heures 30 h Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 9 sur 16 Microbiologie Module 3 Systématique bactérienne Seconde année Théorie Pratique Activités technologiques Repères pour la formation Haemophilus Réaliser l'antibiogramme et le test céfinase. 4 h Il est possible de réaliser une identification de Pasteurella à Pasteurella l'aide d'une galerie API 20E lors de l'étude des pus. Il est possible de réaliser une identification de Campylobacter Campylobacter lors de l'étude des coprocultures. Neisseria, Branhamella Ne pas réaliser d'antibiogramme 4 h Il est possible de réaliser une identification de Listeria Listeria moncytogenes non hémolytique, lors de l'étude des LCR. Corynebacterium 2 h Bactéries anaérobies strictes Réaliser l'identification et éventuellement l'antibiogramme. 6 h Mycobactéries 6 h Total A.T. module 3 22 h Module 4 Microbiologie médicale Seconde année Théorie Pratique Enseignement théorique Repères pour la formation Consacrer deux à trois heures pour la présentation de chaque type d' infection indiqué dans le référentiel, soit environ 20 heures au total. Total cours module 4 22 h Module 4 Microbiologie médicale Seconde année Théorie Pratique Activités technologiques Repères pour la formation 1 . Urines 12 h 2 . Selles 12 h 3 . Hémocultures 12 h 4 . Liquide céphalorachidien 8 h 5 . Pus 6 h 6 . Prélèvement trachéo.bronchiques 12 h 7 . Prélèvement sphère ORL 12 h 8 . Prélèvements génitaux 14 h 9 . Rôle du laboratoires dans la prise 10 h en charge d'une antibiotique 9.1 Détermination de la CMI Il est possible de réaliser la détermination de la CMB 9.2 Association d'antibiotiques Total A.T. module 4 98 h Module 5 Virologie Seconde année Enseignement théorique et Théorie Pratique Repères pour la formation activités technologiques 1 . Généralités sur les virus 6 h Réaliser les sérodiagnostics en utilisant uniquement des 2 . Méthodes de diagnostic 30 h techniques actualisées. 3 . Virologie systématique 14 h Total cours et A.T. module 5 50 h Repères et Horaires BTS ABM 15 12 2008.xls page 10 sur 16 Microbiologie