Mise en place de la détection et quantification de legionella pneumophilia dans les eaux de tours aérorégrigérantes par amplification génique: intérêt vis-à-vis de la culture en présence de flore interférente Élise Bénard To cite this version: Élise Bénard. Mise en place de la détection et quantification de legionella pneumophilia dans les eaux de tours aérorégrigérantes par amplification génique: intérêt vis-à-vis de la culture en présence de flore interférente. Médecine humaine et pathologie. 2016. ￿dumas-01381175￿ HAL Id: dumas-01381175 https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-01381175 Submitted on 14 Oct 2016 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. FACULTE MIXTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE DE ROUEN Année 2016 N° MEMOIRE POUR LE DIPLOME D’ETUDES SPECIALISEES DE BIOLOGIE MEDICALE THESE POUR LE DIPLOME D’ETAT DE DOCTEUR EN MEDECINE Présentée et soutenue publiquement le 30 septembre 2016 Par Elise BENARD Née le 13 novembre 1985 à Harfleur MISE EN PLACE DE LA DETECTION ET QUANTIFICATION DE LEGIONELLA PNEUMOPHILA DANS LES EAUX DE TOURS AEROREFRIGERANTES PAR AMPLIFICATION GENIQUE : INTERET VIS-A-VIS DE LA CULTURE EN PRESENCE DE FLORE INTERFERENTE Président de jury : Professeur Véronique MERLE Directeur de thèse : Docteur Lise GOURICHON Membres du jury : Professeur Martine PESTEL-CARON Docteur Gilles GARGALA Docteur Michèle NOUVELLON ANNEE UNIVERSITAIRE 2015 - 2016 U.F.R. DE MEDECINE ET DE-PHARMACIE DE ROUEN ------------------------- DOYEN : Professeur Pierre FREGER ASSESSEURS : Professeur Michel GUERBET Professeur Benoit VEBER Professeur Pascal JOLY Professeur Stéphane MARRET I - MEDECINE PROFESSEURS DES UNIVERSITES – PRATICIENS HOSPITALIERS Mr Frédéric ANSELME HCN Cardiologie Mme Isabelle AUQUIT AUCKBUR HCN Chirurgie plastique Mr Bruno BACHY (surnombre jusque 01/11/15)) HCN Chirurgie pédiatrique Mr Fabrice BAUER HCN Cardiologie Mme Soumeya BEKRI HCN Biochimie et biologie moléculaire Mr Jacques BENICHOU HCN Bio statistiques et informatique médicale Mr Jean-Paul BESSOU HCN Chirurgie thoracique et cardio-vasculaire Mme Françoise BEURET-BLANQUART HCN Commission E.P.P. D.P.C. Pôle Qualité (surnombre) Mr Guy BONMARCHAND (surnombre) HCN Réanimation médicale Mr Olivier BOYER UFR Immunologie 1 Mr François CARON HCN Maladies infectieuses et tropicales Mr Philippe CHASSAGNE HCN Médecine interne (gériatrie) Mr Vincent COMPERE HCN Anesthésiologie et réanimation chirurgicale Mr Antoine CUVELIER HB Pneumologie Mr Pierre CZERNICHOW HCH Epidémiologie, économie de la santé Mr Jean-Nicolas DACHER HCN Radiologie et imagerie médicale Mr Stéfan DARMONI HCN Informatique médicale et techniques de communication Mr Pierre DECHELOTTE HCN Nutrition Mme Danièle DEHESDIN (surnombre) HCN Oto-rhino-laryngologie Mr Frédéric DI FIORE CB Cancérologie Mr Fabien DOGUET HCN Chirurgie Cardio Vasculaire Mr Jean DOUCET SJ Thérapeutique - Médecine interne et gériatrie Mr Bernard DUBRAY CB Radiothérapie Mr Philippe DUCROTTE HCN Hépato-gastro-entérologie Mr Frank DUJARDIN HCN Chirurgie orthopédique - Traumatologique Mr Fabrice DUPARC HCN Anatomie - Chirurgie orthopédique et traumatologique Mr Eric DURAND HCN Cardiologie Mr Bertrand DUREUIL HCN Anesthésiologie et réanimation chirurgicale Mme Hélène ELTCHANINOFF HCN Cardiologie Mr Thierry FREBOURG UFR Génétique Mr Pierre FREGER HCN Anatomie - Neurochirurgie Mr Jean François GEHANNO HCN Médecine et santé au travail Mr Emmanuel GERARDIN HCN Imagerie médicale Mme Priscille GERARDIN HCN Pédopsychiatrie Mr Michel GODIN (surnombre) HB Néphrologie M. Guillaume GOURCEROL HCN Physiologie Mr Philippe GRISE (surnombre) HCN Urologie Mr Dominique GUERROT HCN Néphrologie Mr Olivier GUILLIN HCN Psychiatrie Adultes Mr Didier HANNEQUIN HCN Neurologie 2 Mr Fabrice JARDIN CB Hématologie Mr Luc-Marie JOLY HCN Médecine d’urgence Mr Pascal JOLY HCN Dermato - Vénéréologie Mme Annie LAQUERRIERE HCN Anatomie et cytologie pathologiques Mr Vincent LAUDENBACH HCN Anesthésie et réanimation chirurgicale Mr Joël LECHEVALLIER HCN Chirurgie infantile Mr Hervé LEFEBVRE HB Endocrinologie et maladies métaboliques Mr Thierry LEQUERRE HB Rhumatologie Mr Eric LEREBOURS HCN Nutrition Mme Anne-Marie LEROI HCN Physiologie Mr Hervé LEVESQUE HB Médecine interne Mme Agnès LIARD-ZMUDA HCN Chirurgie Infantile Mr Pierre Yves LITZLER HCN Chirurgie cardiaque Mr Bertrand MACE HCN Histologie, embryologie, cytogénétique M. David MALTETE HCN Neurologie Mr Christophe MARGUET HCN Pédiatrie Mme Isabelle MARIE HB Médecine interne Mr Jean-Paul MARIE HCN Oto-rhino-laryngologie Mr Loïc MARPEAU HCN Gynécologie - Obstétrique Mr Stéphane MARRET HCN Pédiatrie Mme Véronique MERLE HCN Epidémiologie Mr Pierre MICHEL HCN Hépato-gastro-entérologie Mr Jean-François MUIR HB Pneumologie Mr Marc MURAINE HCN Ophtalmologie Mr Philippe MUSETTE HCN Dermatologie - Vénéréologie Mr Christophe PEILLON HCN Chirurgie générale Mr Christian PFISTER HCN Urologie Mr Jean-Christophe PLANTIER HCN Bactériologie - Virologie Mr Didier PLISSONNIER HCN Chirurgie vasculaire Mr Gaëtan PREVOST HCN Endocrinologie 3 Mr Bernard PROUST HCN Médecine légale Mme Nathalie RIVES HCN Biologie du développement et de la reproduction Mr Jean-Christophe RICHARD (détachement) HCN Réanimation médicale - Médecine d’urgence Mr Vincent RICHARD UFR Pharmacologie Mr Horace ROMAN HCN Gynécologie - Obstétrique Mr Jean-Christophe SABOURIN HCN Anatomie - Pathologie Mr Guillaume SAVOYE HCN Hépato-gastrologie Mme Céline SAVOYE–COLLET HCN Imagerie médicale Mme Pascale SCHNEIDER HCN Pédiatrie Mr Michel SCOTTE HCN Chirurgie digestive Mme Fabienne TAMION HCN Réanimation médicale Mr Luc THIBERVILLE HCN Pneumologie Mr Christian THUILLEZ HB Pharmacologie Mr Hervé TILLY CB Hématologie et transfusion Mr Olivier TROST HCN Chirurgie Maxillo Faciale Mr Jean-Jacques TUECH HCN Chirurgie digestive Mr Jean-Pierre VANNIER HCN Pédiatrie génétique Mr Benoît VEBER HCN Anesthésiologie - Réanimation chirurgicale Mr Pierre VERA CB Biophysique et traitement de l’image Mr Eric VERIN CRMPR Médecine physique et de réadaptation Mr Eric VERSPYCK HCN Gynécologie obstétrique Mr Olivier VITTECOQ HB Rhumatologie Mr Jacques WEBER HCN Physiologie MAITRES DE CONFERENCES DES UNIVERSITES – PRATICIENS HOSPITALIERS Mme Noëlle BARBIER-FREBOURG HCN Bactériologie – Virologie Mr Jeremy BELLIEN HCN Pharmacologie Mme Carole BRASSE LAGNEL HCN Biochimie 4 Mme Valérie BRIDOUX HUYBRECHTS HCN Chirurgie Digestive Mr Gérard BUCHONNET HCN Hématologie Mme Mireille CASTANET HCN Pédiatrie Mme Nathalie CHASTAN HCN Physiologie Mme Sophie CLAEYSSENS HCN Biochimie et biologie moléculaire Mr Moïse COEFFIER HCN Nutrition Mr Stéphane DERREY HCN Neurochirurgie Mr Manuel ETIENNE HCN Maladies infectieuses et tropicales Mr Serge JACQUOT UFR Immunologie Mr Joël LADNER HCN Epidémiologie, économie de la santé Mr Jean-Baptiste LATOUCHE UFR Biologie cellulaire Mr Thomas MOUREZ HCN Bactériologie Mme Muriel QUILLARD HCN Biochimie et biologie moléculaire Mr Mathieu SALAUN HCN Pneumologie Mme Pascale SAUGIER-VEBER HCN Génétique Mme Anne-Claire TOBENAS-DUJARDIN HCN Anatomie PROFESSEUR AGREGE OU CERTIFIE Mme Dominique LANIEZ UFR Anglais Mr Thierry WABLE UFR Communication 5 II - PHARMACIE PROFESSEURS Mr Thierry BESSON Chimie Thérapeutique Mr Jean-Jacques BONNET Pharmacologie Mr Roland CAPRON (PU-PH) Biophysique Mr Jean COSTENTIN (Professeur émérite) Pharmacologie Mme Isabelle DUBUS Biochimie Mr Loïc FAVENNEC (PU-PH) Parasitologie Mr Jean Pierre GOULLE Toxicologie Mr Michel GUERBET Toxicologie Mme Isabelle LEROUX - NICOLLET Physiologie Mme Christelle MONTEIL Toxicologie Mme Martine PESTEL-CARON (PU-PH) Microbiologie Mme Elisabeth SEGUIN Pharmacognosie Mr Rémi VARIN (PU-PH) Pharmacie clinique Mr Jean-Marie VAUGEOIS Pharmacologie Mr Philippe VERITE Chimie analytique MAITRES DE CONFERENCES Mme Cécile BARBOT Chimie Générale et Minérale Mme Dominique BOUCHER Pharmacologie Mr Frédéric BOUNOURE Pharmacie Galénique Mr Abdeslam CHAGRAOUI Physiologie 6 Mme Marie Catherine CONCE-CHEMTOB Législation pharmaceutique et économie de la santé Mme Elizabeth CHOSSON Botanique Mme Cécile CORBIERE Biochimie Mr Eric DITTMAR Biophysique Mme Nathalie DOURMAP Pharmacologie Mme Isabelle DUBUC Pharmacologie Mr Abdelhakim ELOMRI Pharmacognosie Mr François ESTOUR Chimie Organique Mr Gilles GARGALA (MCU-PH) Parasitologie Mme Najla GHARBI Chimie analytique Mme Marie-Laure GROULT Botanique Mr Hervé HUE Biophysique et mathématiques Mme Laetitia LE GOFF Parasitologie - Immunologie Mme Hong LU Biologie Mme Sabine MENAGER Chimie organique Mr Mohamed SKIBA Pharmacie galénique Mme Malika SKIBA Pharmacie galénique Mme Christine THARASSE Chimie thérapeutique Mr Frédéric ZIEGLER Biochimie PROFESSEURS ASSOCIES Mme Cécile GUERARD-DETUNCQ Pharmacie officinale Mr Jean-François HOUIVET Pharmacie officinale PROFESSEUR CERTIFIE Mme Mathilde GUERIN Anglais ASSISTANT HOSPITALO-UNIVERSITAIRE Mr Jérémie MARTINET Immunologie 7 ATTACHES TEMPORAIRES D’ENSEIGNEMENT ET DE RECHERCHE Mr Romy RAZAKANDRAINIBE Parasitologie Mr François HALLOUARD Galénique Mme Caroline LAUGEL Chimie organique Mr Souleymane ABDOUL-AZIZ Biochimie Mme Maïté NIEPCERON Microbiologie 8