DOI: 10.21068/c2021.v22n01a13 Tovar-García & Acevedo-Charry Artículo de datos Conjunto de datos de monitoreo acústico pasivo en la Reserva Natural Los Yátaros, Gachantivá, Boyacá, Colombia Dataset of passive acoustic monitoring at the Nature Reserve Los Yátaros, Gachantivá, Boyacá, Colombia Juan Diego Tovar García , Orlando Acevedo-Charry Resumen El monitoreo acústico pasivo es una técnica en la cual se instalan grabadoras con una programación particular de grabación, sin que haya interferencia del observador. A pesar de su reciente interés, muchos lugares en el Neotrópico aún no cuentan con información sobre su actividad acústica. Los eventos de muestreo acústico pa- sivo de este tipo pueden aportar en un futuro a contestar diferentes preguntas sobre la diversidad acústica del Neotrópico. Presentamos un conjunto de datos de eventos de muestreo acústico pasivo realizados durante el primer semestre de 2020 en la Reserva Natural Los Yátaros, a 6 km de Gachantivá, Boyacá, cordillera Oriental de Colombia. El muestreo consistió en instalar seis grabadoras automáticas AudioMoth, dos en cada sitio de mues- treo (n=3). Programamos las AudioMoth para grabar 1 minuto de audio cada 30 minutos a lo largo de todo el día (00:00-23:30) para espectro audible (0 Hz-16 kHz) y en las noches (16:30-06:00) para ultrasonido (hasta 192 kHz). El muestreo se desarrolló desde el 1 de marzo hasta el 2 de mayo del 2020, acumulando en total 12 447 grabacio- nes, 9055 de espectro audible y 3392 de ultrasonido. Palabras clave. Actividad acústica. Andes orientales. Alto Ricaurte. Huella acústica. Paisaje sonoro. Abstract Passive acoustic monitoring is a technique in which acoustic sensors are placed with a particular recording set- ting, without interference from the observer. Despite the recent interest, many places in the Neotropics still do not have information on acoustic activity. Such acoustic sampling events would contribute to answer different questions about the acoustic diversity in the Neotropics. We present the dataset of passive acoustic sampling events during the first semester of 2020, at the Natural Reserve Los Yátaros, 6 km away of Gachantivá, Boyacá, Eastern Andes of Colombia. Sampling consisted of installing six AudioMoth acoustic sensors, two at each sam- pling site (n=3). We programmed all acoustic sensors to record 1 min every 30 minutes throughout the day (00:00- 23:30) to audible spectrum (0 Hz-16 kHz), and at night (16:30-06:00) to ultrasound spectrum (up to 192 kHz). The monitoring was conducted from March 1 to May 2, 2020, gathering 12 447 recording, 9055 audible and 3392 ultrasound recordings. Keywords. Acoustic activity. Acoustic footprint. Eastern Andes. Ricaurte province. Soundscape. 200 | Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 Tovar-García & Acevedo-Charry Monitoreo acústico pasivo en la Reserva Natural Los Yátaros Introducción muy poco se ha estudiado en referencia a la actividad acústica (Fitzgerald & Bider, 1974). Las regiones tropicales son uno de los lugares más biodiversos acústicamente del mundo (Luther & El monitoreo acústico tradicional se enfoca en la ob- Gentry, 2013), pero aún con vacíos de conocimiento servación directa del organismo vocalmente activo sobre su actividad acústica (Deichmann et al., 2018). (Parker, 1991), mientras el monitoreo acústico pasi- Para intentar comprender otras dimensiones de la vo utiliza grabadoras colocadas en un área de estudio biodiversidad, recientemente ha surgido el estudio de para grabar vocalizaciones y luego detectar la pre- los paisajes sonoros (Rodríguez-Buriticá et al., 2019). sencia de los individuos (Blumstein et al., 2011). Los Los paisajes sonoros son la composición de todos los métodos acústicos ofrecen una forma eficiente para sonidos dentro de un área y momento particular, in- obtener de forma autónoma grandes cantidades de cluyendo sonidos biológicos producidos por ani- información, continua, simultánea y de registros per- males (biofonía), sonidos no biológicos ambientales manentes que reflejan la actividad acústica que pueden como la lluvia, viento, truenos y cascadas (geofonía), ser utilizada nuevamente para responder diferentes y los sonidos producidos por la actividad humana preguntas o complementar diferentes metodologías (antropofonía; Pijanowski et al., 2011). Estudiar el (Boquimpani-Freitas et al., 2007; Aide et al., 2013; La- paisaje sonoro ha tomado relativa relevancia en los verde et al., 2017). El objetivo de presentar un conjunto últimos años, ya que mediante el análisis de los so- de datos de eventos de muestreo acústico es dejar dis- nidos pueden responderse preguntas sobre patrones ponible la información primaria levantada en el cam- de actividad, incluyendo amplias escalas espaciales, po (archivos de audio), en este caso para una reserva y realizando monitoreo de especies específicas para privada del municipio de Gachantivá. Los archivos de entender la relación de actividad acústica con impac- audio serán usados para investigar cómo está compues- to por actividades humana (Deichmann et al., 2017; ta la huella acústica de la reserva en los tres puntos de Sueur & Farina, 2015; Campos-Cerqueira et al., 2020; muestreo a lo largo de nueve semanas, lo cual puede Ducrettet et al., 2020). luego contrastarse con factores ambientales (precipi- tación, luz ambiental) que ayuden a explicar cambios En los últimos años se han venido realizando cada en la estructura acústica. vez más intensamente estudios sobre la actividad acústica (Farina et al., 2014; Boquimpani-Freitas et al., 2007; Schmidt & Balakrishnan, 2014). Cambios Datos del Proyecto en la actividad vocal debido a factores temporales y ambientales puede proporcionar información so- Título: Conjunto de datos de monitoreo acústico pasi- bre la respuesta comportamental referentes a señales vo en la Reserva Natural Los Yátaros de Gachantivá, acústicas. El clima, por ejemplo, puede influenciar Boyacá, Colombia. el comportamiento y por ende el repertorio vocal de las especies. La precipitación puede restringir las ex- Personas asociadas: Juan Diego Tovar García hibiciones territoriales (Bas et al., 2008) y alterar la complejidad del repertorio vocal (Medina & Francis, Fuentes de financiación: 2012). En anuros, largas temporadas de lluvia puede alterar la actividad acústica, como también influen- Fuentes propias. ciar cambios poblacionales (Stewart, 1995), y en otros casos, la precipitación da lugar a estanques efíme- Descripción del área de estudio ros donde se reúnen múltiples especies de anuros para vocalizar (Ulloa et al., 2019). Los niveles de luz Los datos fueron recolectados en el noreste de los Andes ambiental también han demostrado tener un efec- colombianos, en la Reserva Natural Los Yátaros, vereda to en la reproducción, forrajeo e interacciones entre La Caja, del municipio de Gachantivá, departamento depredador-presa para especies nocturnas de aves de Boyacá. La reserva está compuesta por robledales y (Kronfeld-Schor et al., 2013). En anuros, efectos de la bosque sub andino en diferentes estadios de regenera- luz ambiental han sido relacionados con el compor- ción natural. El muestreo fue desarrollado desde el 1 tamiento durante las temporadas de reproducción de marzo hasta el 2 de mayo del 2020, lo cual incluye 9 (Vignoli & Luiselli, 2013; Onorati & Vignoli, 2017) y semanas de grabación. Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 | 201 DOI: 10.21068/c2021.v22n01a13 Tovar-García & Acevedo-Charry Descripción del proyecto: y bosque subandino en diferentes estadios de regene- ración natural secundaria. El muestreo se desarrolló El proyecto buscó tener un conjunto de datos de los desde el 1 de marzo hasta el 2 de mayo del 2020, lo cual sonidos en espectro audible y en ultrasonido de los incluye nueve semanas de grabación. componentes de la huella acústica de la reserva. Para esto, escogimos tres puntos en el sendero principal, se- Descripción del muestreo parando cada punto de muestreo por más de 150 m. En cada punto instalamos dos grabadoras AudioMoth a Realizamos nueve semanas de grabación en tres puntos diferente tasa de muestreo, posicionadas a alturas di- a lo largo del camino principal de la reserva, usando ferentes. Las grabaciones fueron ingresadas a la Colec- grabadoras autónomas AudioMoth, grabando todos los ción de Sonidos Ambientales y esperan ser analizadas sonidos presentes (biofonía, geofonía y antropofonía). durante los próximos meses. Instalamos dos grabadoras AudioMoth por cada sitio de muestreo (n=3) a lo largo del camino principal den- tro de la reserva (Figura 1). Cada punto de muestreo Cobertura geográfica estuvo separado por mas de 150 m de los otros, para evitar pseudorréplicas y asumiendo una independencia Descripción. entre los puntos. La programación de las grabadoras fue de 1 minuto de grabación cada 30 minutos duran- En la Reserva Natural Los Yátaros. Departamento de te todo el día (00:00-23:30) para un set de grabadoras Boyacá, Municipio de Gachantivá, Vereda La Caja (3) a una tasa de muestreo de 32 kHz, y 1 minuto de (Figura 1). grabación cada 30 minutos durante la noche para otro set de grabadoras (3) a 384 kHz, todas en formato de Coordenadas: 5°47’25.6” N, 73°33’24” O y 5°47’21.3” audio no comprimido (wav) y con una ganancia alta. N, 73°33’ 1.6” O. Las grabadoras de espectro audible (32 kHz) las ins- talamos a 1.5 m del suelo, mientras que las de ultra- Cobertura temporal: 01 de marzo de 2020-02 de mayo frecuencia (384 kHz), a 2.5 m del suelo. El esfuerzo de de 2020 muestreo fue de nueve semanas, del 1 de marzo al 02 de mayo del 2020. Datos de la colección Control de calidad. Previo a la programación de las Nombre de la colección: Colección de Sonidos Ambien- grabadoras AudioMoth, realizamos pruebas dentro de tales del Instituto de Investigación de Recursos Bioló- las instalaciones de la Colección de Sonidos Ambien- gicos Alexander von Humboldt. tales en la sede Villa de Leyva del Instituto Humboldt, seleccionando aquellas grabadoras que tuvieran un Identificador de la colección: IAvH-CSA, Registro Na- buen estado general, con el interruptor on/off com- cional de Colecciones 3 pleto, y que no tuvieran partes oxidadas. Realizamos una prueba de grabación para verificar el correcto fun- Identificador de la colección parental: IAvH cionamiento. Aleatoriamente, algunas grabaciones de espectro audible y de ultrasonido fueron seleccionadas Método de preservación de los audios: Archivos digi- para confirmar su estado. Los datos fueron corrobora- tales en formato WAV dos por la Infraestructura Institucional del Instituto Humboldt (I2D). Materiales y Métodos Descripción de la metodología paso a paso. Área de estudio Programación para la toma de los datos acústico: Usa- mos el programa “AudioMothTime” para ajustar cada Los datos fueron recolectados en el noreste de los Andes grabadora en UTC-5, correspondiente a la hora local co- colombianos en la Reserva Natural Los Yátaros, vereda lombiana, confirmando que la hora y la fecha estuvieran La Caja, del municipio de Gachantivá, departamento correctas. Con el programa “AudioMothConfig” confi- de Boyacá (Figura 1). La reserva queda a 6 km del casco guramos los periodos de grabación y programación de urbano de Gachantivá, y está compuesta por robledales encendido y apagado de la grabadora. 202 | Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 Tovar-García & Acevedo-Charry Monitoreo acústico pasivo en la Reserva Natural Los Yátaros Figura 1. Área de muestreo detallando cada uno de los tres sitios de muestreo en donde se colocaron las grabadoras Audio- Moth en la Reserva Natural Los Yátaros, Boyacá, Colombia. Figure 1. Study area detailing each sampling site where the autonomous AudioMoth recording where placed at the Nature Reserve Los Yátaros, Boyacá, Colombia. Frecuencia de grabación: Programamos grabar 1 minu- Altura de las AudioMoth: Las grabadoras programa- to por cada 30 minutos a lo largo de todo el día (00:00- das en espectro audible fueron instaladas a 1.5 metros 23:30) para espectro audible y 1 minuto por cada 30 de altura en referencia al suelo, mientras que las gra- minutos en la noche (16:30-06:00) para ultrasonido. badoras programadas para ultrasonido a 2.5 metros de altura. Ajuste de las AudioMoth – espectro audible: Tasa de muestreo: 32 kHz; ganancia: alta; duración de pausa o Una vez montadas el par de grabadoras por punto de no grabación: 1760 segundos; duración de grabación: muestreo, registramos metadatos como: coordenadas, 60 segundos. elevación (m. s.n.m) y nombre del punto de muestreo. Ajuste de las AudioMoth – ultrasonido: Tasa de mues- Las grabaciones en espectro audible están siendo subi- treo: 384 kHz; ganancia: alta; duración pausa o no das a la plataforma de análisis acústico ARBIMON, para grabación: 1760 segundos; duración de grabación: 60 generar representaciones gráficas de la huella acústica segundos. por semana por sitio (Deichmann et al., 2017). Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 | 203 DOI: 10.21068/c2021.v22n01a13 Tovar-García & Acevedo-Charry Resultados Nombre. Conjunto de datos de monitoreo acústico pa- sivo en la Reserva Natural Los Yátaros de Gachantivá, Reportamos 12 447 registros de audio proveniente de Boyacá, Colombia. muestreo pasivo con sensores acústicos de la Reserva Natural Los Yátaros en Gachantivá, Boyacá, Colombia Idioma. Español (Tabla 1). El conjunto de datos puede ser accedido en el IPT del Instituto Humboldt, el cual se replica en los Codificación de caracteres. UTF-8 portales SiB Colombia y GBIF. Para acceder a los da- tos y al URL único de cada evento de muestreo acús- URL del archivo. Para acceder a la versión del conjunto tico pasivo se debe descargar el archivo DarwinCore de datos descrita en este artículo: (DwC-A), lo cual genera una carpeta en las descargas con varios archivos *.txt que se vinculan con la colum- IPT. https://ipt.biodiversidad.co/biota/resource? na “id”; de particular interés los archivos “event.txt” y r=map_yataros_2020 “multimedia.txt” permiten acceder a los datos crudos de cada evento de muestreo y al enlace de acceso al Formato del archivo. Darwin Core Archive audio. Recomendamos abrirlos con un editor de texto, copiar y pegar en Excel utilizando la herramienta de Fecha de publicación de los datos. 2020-05-18 pegado de texto “Wizard” para definir el separador de columnas. Nuestro fin último es que estos even- Idioma de los metadatos. Español tos acústicos, con sus datos relacionados, puedan ser dispuestos en una plataforma nacional de acceso y Licencia de uso. Creative Commons Attribution Non análisis específica para este tipo de información en Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License. un futuro cercano. Descripción del conjunto de datos Discusión URL del recurso. Para acceder a la última versión del Este es un artículo de datos pionero sobre eventos pa- conjunto de datos. sivos de muestreo acústico para un sitio en particu- lar. La publicación de otros artículos de datos sobre IPT. https://doi.org/10.15472/wt0elp sonidos del departamento de Boyacá han incluido grabaciones direccionales mantenidas en repositorios Portal SiB Colombia. https://datos.biodiversidad.co/ particulares (Buitrago-Cardona et al., 2020). Con la in- dataset/8f77f7e5-139f-46ef-a84b-ed9020168dea clusión de muestreo pasivo para monitorear los pai- sajes sonoros se puede evaluar el estado en el que se Portal GBIF. https://www.gbif.org/dataset/ encuentra un ecosistema haciendo uso de la actividad 8f77f7e5-139f-46ef-a84b-ed9020168dea acústica (Pijanowski et al., 2011; Deichmann et al., 2017). Tabla 1. Número de grabaciones obtenidas por cada uno de los sitios de muestreo. Table 1. Number of recordings for each sampling site. Sitio Latitud Longitud Elevación (m) Frecuencia Acústica # de Grabaciones Yat1 5.78926 -73.55044 2300–2325 0 Hz–24 kHz 3019 5.78926 -73.55044 2300–2325 0 kHz–192 kHz 996 Yat2 5.78938 -73.54900 2300–2325 0 Hz–24 kHz 3018 5.78938 -73.54900 2300–2325 0 kHz–192 kHz 968 Yat3 5.79044 -73.54983 2300–2325 0 Hz–24 kHz 3018 5.79044 -73.54983 2300–2325 0 kHz–192 kHz 1428 204 | Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 Tovar-García & Acevedo-Charry Monitoreo acústico pasivo en la Reserva Natural Los Yátaros Figura 2. Representación tridimensional del paisaje sonoro para dos semanas (W3, W4) en tres sitios (Y1, Y2, Y3) en la Reser- va Natural Los Yátaros, Boyacá, Colombia. Eje horizontal (X) representa la hora del día, eje vertical (Y) representa la frecuen- cia acústica (en subconjunto de 0-10 kHz) y los colores (Z) representa la proporción de grabaciones con un pico de amplitud mayor a 0.06. Figure 2. Tridimensional representation of the soundscape in two weeks (W3, W4) for the three sites (Y1, Y2, Y3) at the Los Yátaros Nature Reserve, Boyacá, Colombia. Horizontal axis (X) represents time of the day, vertical axis (Y) acoustic frequency (in 0-10 Hz subsets) and colors (Z) the proportion of recordings with a peak amplitude greater than 0.06. Aunque monitorear la respuesta de diferentes taxones En nuestra área de estudio, este conjunto de datos pue- de animales simultáneamente es aún un reto, con la ayu- de ayudar a crear una representación visual de los da de nuevas herramientas emergentes (e.g., ARBIMON paisajes sonoros, lo cual puede resaltar las horas del II, paquetes en R o Python), la detección e identificación día más activas vocalmente como picos de actividad. de los individuos vocalmente activos se espera que sea Estos picos de actividad en algunos datos bajo actual cada vez más fácil (Deichmann et al., 2018; Ducrettet análisis muestran un coro durante la mañana, en el que et al., 2020). la mayoría de las vocalizaciones fueron producidas Biota ColomBiana 22 (1) - 2021 | 205 DOI: 10.21068/c2021.v22n01a13 Tovar-García & Acevedo-Charry por aves, y otro coro en el atardecer, en el que hubo Boquimpani-Freitas, L., Ventura Marra, R., Van Sluys, presencia acústica de aves, anfibios e insectos. Los in- M., & Duarte Rocha, C. (2007). Temporal niche of sectos hacen una proporción substancial en el paisaje acoustic activity in anurans: interspecific and sea- sonoro, mostrando picos de actividad a lo largo de sonal variation in a neotropical assemblage from toda la noche, y solapándose con el coro de amanecer south-eastern Brazil. Amphibia-Reptilia, 28, 269-276. y atardecer. Hasta el momento, tres especies diferentes https://doi.org/10.1163/156853807780202422 de anuros han sido identificados en las grabaciones, Buitrago-Cardona, A., Colón-Piñeiro, Z., Borja-Acosta, los cuales servirán para futuros análisis de la actividad K., Ospina-L., A., Galeano, S. P., & Acevedo-Charry, acústica de este grupo en la reserva. De igual modo, O. (2020). Dataset on audio records of animals from es evidente la influencia diferencial que ejerce sobre the northeast Andes of Colombia I: The bird sounds el paisaje sonoro el cambio de lluvias de una semana of Boyacá department. Data in Brief, 28, 104941. a otra (Figura 2), lo cual puede influenciar la activi- https://doi.org/10.1016/j.dib.2019.104941 dad acústica dentro de la reserva (Ulloa et al., 2019). El Campos-Cerqueira, M., Mena, J., Tejeda-Gómez, V., actual monitoreo acústico espera ser continuado para Aguilar-Amuchastegui, N., Gutierrez, N., & Aide, abordar preguntas a escala temporal anual dentro del T. M. (2020). How does FSC forest certification affect área de estudio. the acoustically active fauna in Madre de Dios, Peru? Remote Sensing In Ecology and Conservation, Early View. Agradecimientos. https://doi.org/10.1002/rse2.120 Deichmann, J., Hernández-Serna, A., Delgado C., Estos datos los obtuvimos durante la pasantía de JDTG J., Campos-Cerqueira, M., & Aide, T. M. (2017). en el Instituto Humboldt bajo la supervisión de OAC. Soundscape analysis and acoustic monitoring do- Agradecemos en particular a Esmeralda y Pablo Fore- cument impacts of natural gas exploration on bio- ro por permitirnos realizar este proyecto en la Reserva diversity in a tropical forest. Ecological Indicators, 74, Natural Los Yátaros y por todo el apoyo que brindaron. 39-48. Fernando Forero y Zuania Colón también apoyaron y https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2016.11.002 fomentaron planteamientos de monitoreo e investiga- Deichmann, J., Acevedo-Charry, O., Barclay, L., Buri- ción dentro de la reserva. A los revisores y al equipo valova, Z., Campos-Cerqueira, M., & d’Horta, F., editorial que lideró este número especial sobre Ecoa- Game, E., Gottesman, B., Hart, P., Kalan, A., Linke, cústica Neotropical. S., Nacimento, Pijanowski, B., Staaterman, E., Aide, T. M. (2018). It’s time to listen: there is much to be learned from the sounds of tropical ecosystems. Bio- Referencias tropica, 50(5), 713-718. https://doi.org/10.1111/btp.12593 Aide, T.M., Corrada-Bravo, C., Campos-Cerqueira, M., Ducrettet, M., Forget, P., Ulloa, J., Yguel, B., Gaucher, Milan, C., Vega, G., & Alvarez, R. (2013). Real-ti- P., Princé, K., Haupert, S., & Sueur, J. (2020). Moni- me bioacoustics monitoring and automated species toring canopy bird activity in disturbed landscapes identification. PeerJ, 1, e103. with automatic recorders: A case study in the tro- https://doi.org/10.7717/peerj.103 pics. Biological Conservation, 245, 108574. Bas, Y., Devictor, V., Moussus, J., & Jiguet. F. (2008). https://doi.org/10.1016/j.biocon.2020.108574 Accounting for weather and time-of-day parameters Farina, A., Pieretti, N., & Malavasi, R. (2014). Patterns when analysing count data from monitoring pro- and dynamics of (bird) soundscapes: A biosemiotic grams. Biodiversity and Conservation, 17, 3403-3416. interpretation. 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Instituto de Investigación de Recursos Biológicos https://doi.org/10.21068/c2021.v22n01a13 Alexander von Humboldt Bogotá, Colombia [email protected] Recibido: 30 de mayo 2020 https://orcid.org/0000-0003-4964-8994 Aceptado: 9 de noviembre 2020 208 | Biota ColomBiana 22 (1) - 2021