ANDERSON GARCIA ESTRUTURA E FUNÇÃO DA PROTEÍNA YacG de Klebsiella pneumoniae e SEUS DERIVADOS PEPTÍDICOS. Tese apresentada ao Instituto de Química, Universidade Estadual Paulista, como parte dos requisitos para obtenção do título de Doutor em Biotecnologia. Orientador: Prof. Dr. Reinaldo Marchetto Araraquara- SP 2015 FICHA CATALOGRÁFICA Garcia, Anderson G216e Estrutura e função da proteína YacG de Klebsiella pneumoniae e seus derivados peptídicos / Anderson Garcia. – Araraquara : [s.n], 2015 141 f. : il. Tese (doutorado) – Universidade Estadual Paulista, Instituto de Química Orientador: Reinaldo Marchetto 1. Inibidores enzimáticos. 2. Metaloproteínas. 3. Peptídeos - síntese. 4. Proteínas recombinantes. 5. Agentes antibacterianos. I. Título. Elaboração: Diretoria Técnica de Biblioteca e Documentação do Instituto de Química de Araraquara Seção Técnica de Aquisição e Tratamento da Informação DADOS CURRICULARES Nome: Anderson Garcia Nome em citações bibliográficas: GARCIA, A. Filiação: Maria Rosely Garcia Quintino Local e Data de nascimento: 22/10/1983, Ourinhos-SP Estado civil: solteiro Endereço: Rua Francisco Pires 151, Vila Margarida, Ourinhos -SP CEP: 19907-400 Telefone: (14) 3302-6400 ramal 6475 / (16)98109-1078 E-mail: [email protected] Resumo das qualificações: Mestre em Biotecnologia pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - Unesp, na área de síntese de peptídeos com ênfase em peptídeos antimicrobianos , Especialista em Bioquímica Aplicada pela Universidade Estadual De Londrina UEL (2007), Licenciado em Ciências Biológicas pelas Faculdades Integradas de Ourinhos FIO. FORMAÇÃO ACADÊMICA 2008 - 2010 Mestrado em Biotecnologia Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita Filho, Unesp, Instituto de Química de Araraquara. Título: Peptídeos derivados da proteína bacteriana YacG: Síntese e estudos de estrutura-função. Orientador: Prof. Dr. Reinaldo Marchetto. Bolsista Capes - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior 2007 - 2007 Especialista em Bioquímica Aplicada Universidade Estadual de Londrina – UEL Título: Produção de L-asparaginase por Zymomonas mobilis CP4, na fermentação de garapa. Orientador: João Batista Buzato 2003 - 2005 Licenciatura em Ciências Biológicas Faculdades Integradas de Ourinhos Título: Generalidades sobre o câncer e sua incidência na população de Ipaussu. Orientador: Dalva Regina do Amaral Teixeira ATUAÇÃO PROFISSIONAL Professor Universitário Faculdades Integradas de Ourinhos FIO De 02/02/2015 até o momento. TRABALHOS APRESENTADOS EM EVENTOS GARCIA, A., ZOTTIS, A., ABREU, E. M., MARCHETTO, R. New DNA gyrase Inhibitor based on YacG protein Structure. In: 5th European Conference on Chemistry for Life Sciences, 2013, Barcelona. ECCLS 2013 Abstracts Book. Barcelona: Barceló Events, 2013. v.1. p.171-171; ROCHA, C. A., GARCIA, A., SANCHEZ, P. R. S., ABREU, E. M., MARCHETTO, R. New Peptide Inhibitors of Bacterial Topoisomerases In: XLII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2013, Foz do iguaçu. XLII SBBq Abstracts. 2013. GARCIA, A., ROSSI, D., BARBOSA, L. C. B., DELFINO, D. B., GARRIDO, S. S., MARCHETTO, R., VALENTINI, S. R. Klebsiella pneumoniae YacG is a specific inhibitor of DNA gyrase In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular – SBBq, 2012. BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., DELFINO, D. B., MARCHETTO, R. Peptides from E. coli ParE as Inhibitors of Topoisomerases: Screening and Characterization of Protein-protein Interactions In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 2012. DELFINO, D. B., BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., GARRIDO, S. S., MARCHETTO, R.Design and Synthesis of a New Peptide Inhibitor of Topoisomerase IV In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 2012. GARCIA, A., LARISSA, BARBOSA, L. C. B., DELFINO, D. B., GARRIDO, S. S., MARCHETTO, R. Synthetic Peptides from YacG Protein as New Antimicrobials Agents In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. , 2011. DELFINO, D. B., BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., LARISSA, GARRIDO, S. S., MARCHETTO, R. Nanoemulsion as Promoter of Permeability for Peptide Inhibitor of Bacterial Topoisomerases In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,, 2011, Foz do Iguaçu. XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,. , 2011. ARTIGOS PUBLICADOS BARBOSA, L. C. B., GARCIA, A., GARRIDO, S. S., DELFINO, D. B., SANTOS, L. N., MARCHETTO, R. Design and Synthesis of Peptides from Bacterial ParE Toxin as Inhibitors of Topoisomerases. European Journal of Medicinal Chemistry. v.54, p.591 - 596, 2012. BARBOSA, L. C. B.; GARRIDO, S. S.; GARCIA, A.; DELFINO, D. B.; MARCHETTO, R. Function inferences from a molecular structural model of bacterial ParE toxin. Bioinformation , v. 4(10), p. 438-440, 2010. BARBOSA, L. C. B.; GARRIDO, S. S.; GARCIA, A.; DELFINO, D. B.; GONCALVES, R. D.; MARCHETTO, R. Easy Bioinformatics Analysis (EBiAn): a package for manipulating and analyzing of short biological sequences. Bioinformation , v. 5(2), p. 43-45, 2010. OUTROS GARRIDO, S. S., GARCIA, A., MARCHETTO, R. Participação em banca de MÁRCIO FALCI PENNISI. SÍNTESE E APLICAÇÕES DE INIBIDORES PEPTÍDICOS DE TOPOISOMERASES ASSOCIADOS A SISTEMAS DE LIBERAÇÃO CONTROLADA DE FÁRMACOS, 2012 (Farmácia e Bioquímica) Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho Avaliador da primeira fase do XXV Congresso de Iniciação Científica da UNESP 2013. IDIOMAS 1. Inglês: Básico A minha esposa Ariane Aos meus filhos Augusto e Arthur (que ainda está por vir) A minha mãe, padrasto e irmão A minha avó (em memória) A todos que me deram forças nesta longa caminhada AGRADECIMENTOS Ao meu orientador, Prof. Dr. Reinaldo Marchetto por ter aceito mais este desafio, pela sua contribuição e convivência ao longo deste período; À minha colaboradora, Dra. Danuza Rossi, ao qual teve um papel de extrema importância no desenvolvimento deste trabalho Ao Prof. Dr. Eduardo Maffud Cilli, por sua contribuição nas condutas de laboratório, instruções na operação de equipamentos, por não medir esforços em ajudar sempre que possível e pela boa convivência; Ao Prof. Dr. Saulo Santesso Garrido, pela sua contribuição através de discussões e compartilhar idéias, sempre com o intuito de sempre melhorar o trabalho e pela amizade adquirida; Aos colegas de grupo, Camila, Ana Caires, Rute, Edson (Araketu), Aderson e Edson (Crusca), pela boa convivência e amizade; Aos demais colegas de laboratório, Mateus, Norival, Nata, Júlia, Esteban, Isabelle, Aline e Paulo, pela boa convivência; A todos os funcionários da seção de pós-graduação e técnicos do Departamento de Bioquímica e Tecnologia Química;